绩效工资在员工工资里扣除是否违法，需根据具体情况判断。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：

一、合法扣除绩效工资的情况

1. 有明确的绩效考核制度与劳动合同约定

   • 用人单位需具备明确、合理的绩效工资考核制度，该制度应经过民主程序制定，并向员工公示或告知。同时，劳动合同中应明确约定绩效工资的考核标准、发放方式及条件等内容。当员工绩效未达到约定标准时，用人单位可依据合同和制度规定合法扣除绩效工资。
   • 例子：某公司制定了详细的绩效考核制度，并在员工入职时进行了告知。制度中明确规定，若员工连续两个月绩效未达标，将扣除当月绩效工资的20%。某员工连续两个月绩效未达标，公司依据制度扣除了其绩效工资，这一行为是合法的。

2. 符合法定扣除情形

   • 用人单位在特定情况下可代扣劳动者工资，如代扣代缴的个人所得税、社会保险费用等。若绩效工资的扣除符合这些法定情形，则属于合法扣除。

3. 劳动者自身过错导致

   • 若劳动者因故意或重大过失给用人单位造成经济损失，用人单位可根据劳动合同约定要求其赔偿经济损失，并从绩效工资中合理扣除。但每月扣除部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准。
   • 例子：某员工因疏忽导致公司货物损坏，造成经济损失5000元。公司根据劳动合同约定，要求该员工赔偿，并从其绩效工资中扣除。若扣除后员工工资仍不低于当地最低工资标准，则这一行为是合法的。

二、非法扣除绩效工资的情况

1. 无正当理由或随意扣除

   • 用人单位若无正当理由或随意更改考核标准后扣除绩效工资，或扣除理由不充分、不合理，均构成非法扣除。
   • 例子：某公司未制定明确的绩效考核制度，却随意以“表现不佳”为由扣除员工绩效工资。这一行为缺乏合法依据，构成非法扣除。

2. 恶意扣除

   • 用人单位以绩效之名行克扣工资之实，如为惩罚员工、强迫员工离职等目的而恶意扣除绩效工资，属于违法行为。

3. 扣除后低于最低工资标准

   • 用人单位扣除绩效工资后，若员工工资低于当地最低工资标准，则此扣除行为不合法。用人单位必须确保员工获得不低于最低工资标准的劳动报酬。

4. 制度不合理或未公示

   • 若用人单位的绩效工资考核制度存在重大漏洞、显失公平，或未经过民主程序制定、未向员工公示或告知，则依据该制度扣除绩效工资可能构成违法。

三、员工维权途径

1. 与用人单位沟通

   • 员工首先应与用人单位进行沟通，了解扣除绩效工资的具体原因和依据，并要求给出合理解释。

2. 向劳动监察部门投诉

   • 若沟通无果，员工可向当地劳动监察部门投诉，请求介入调查并处理。

3. 申请劳动仲裁或提起诉讼

   • 若劳动监察部门未能解决问题，员工可向劳动争议仲裁机关申请仲裁。对仲裁裁决不服的，还可向人民法院提起诉讼以维护自己的合法权益。

总结与建议：绩效工资被扣是否违法，需综合考虑多方面因素。作为员工，应了解自己的权益和可能的维权途径。在面临此类问题时，建议首先与用人单位进行沟通，了解扣除的具体原因和依据。若沟通无果，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。如有需要，也可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更详细的法律建议。