在二手房交易中，关于个税由买方承担是否合法的问题，我们可以从法律层面和实践操作层面进行详细分析。
法律层面：
税收法定原则：根据《中华人民共和国个人所得税法》的相关规定，个人所得税是对个人取得的应税所得征收的一种税，其中就包括财产转让所得。在二手房交易中，卖方因出售房屋获得收入，属于应税所得范畴，因此卖方是法定的纳税义务人。然而，这并不意味着在实际交易中个税不能由买方承担。纳税义务在法律上的规定，并不妨碍买卖双方通过民事约定来改变税负的实际承担者。
民事约定原则：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，买卖双方在合同中可以自由约定交易的相关条款，包括税费的承担。只要这种约定是双方真实意思的表示，且不违反法律法规的强制性规定，那么这种约定就是有效的。因此，在二手房交易中，买卖双方完全可以通过协商，在房屋买卖合同中明确约定由买方承担卖方应缴纳的个人所得税。
实践操作层面：
市场行情影响：二手房交易市场中的供求关系会影响双方的议价能力和合同约定。在卖方市场下，由于房源稀缺，卖方可能更倾向于将税负转嫁给买方；而在买方市场下，由于房源充足，买方则可能有更多话语权来争取更有利的条款。
明确约定条款：为了避免后续纠纷，双方应在合同中明确写明税费承担的具体条款。这包括但不限于个税的承担方、承担方式以及可能的税务风险分担等。明确的约定有助于保障双方的权益，减少不必要的争议。
潜在风险考虑：买方在承担个税时，应充分了解并遵守相关税法规定。如果买方对税法不熟悉，可能会因操作不当而产生不必要的风险。同时，双方应确保税费承担的约定不违反税收法规的强制性规定，以避免潜在的税务纠纷。
注意事项：
合法性检查：在签订合同时，双方应确保税费承担的约定符合相关法律法规的要求。如果约定违法，那么这种约定将是无效的，并可能给双方带来法律风险。
税务咨询：对于复杂的税务问题，建议双方咨询专业的税务机构或律师。他们可以提供专业的意见和建议，帮助双方确保交易的合法性和顺利进行。
保留证据：在交易过程中，双方应妥善保管相关证据和文件，如合同、付款凭证、税务申报表等。这些证据和文件在后续可能发生的纠纷中具有重要的证明作用。
综上所述，二手房个税由买方承担在民事约定层面是合法的。但双方应确保约定的明确性、合法性和可操作性，并充分考虑市场行情和潜在风险。在实际操作中，建议双方咨询专业人士以确保交易的顺利进行。