结论前置：劳动合同中不直接写工资，而是将工资条款写在协议上，这样的安排并不必然导致劳动合同无效，但可能存在一定风险。关键在于该协议是否构成劳动合同的有效组成部分，以及双方是否就工资条款达成一致。
一、劳动合同的有效性分析
根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，劳动合同应当具备劳动报酬等必备条款。然而，法律并未明确规定工资条款必须直接写在劳动合同文本中，只要双方通过其他形式（如补充协议）对工资进行了明确约定，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么这样的安排是可以被接受的。
劳动合同的必备条款：劳动合同应当包含用人单位和劳动者的基本信息、劳动合同期限、工作内容和工作地点、工作时间和休息休假、劳动报酬、社会保险等必备条款。虽然劳动报酬是必备条款之一，但并未限定其必须出现在劳动合同的主文中。
协议的有效性：如果双方通过补充协议对工资进行了明确约定，且该协议是双方真实意思的表示，不存在欺诈、胁迫等情形，那么该协议是有效的。此时，劳动合同和补充协议共同构成了双方之间的完整约定。
二、潜在风险与防范
尽管将工资条款写在协议上可能不违反法律规定，但这样的安排可能带来一些潜在风险，需要双方注意防范：
协议与劳动合同的关联性：确保补充协议与劳动合同之间存在明确的关联，避免出现协议与劳动合同脱节或相互矛盾的情况。可以在劳动合同中明确提及补充协议的存在，并说明补充协议是劳动合同的组成部分。
协议的明确性：补充协议中应详细、明确地约定工资数额、支付方式、支付时间等关键条款，避免出现模糊不清或容易产生歧义的表述。
证据保留：双方应妥善保管好劳动合同和补充协议等书面证据，以备在发生争议时能够提供有力的证明。
三、法律建议
完善合同条款：为了降低风险，建议用人单位在签订劳动合同时，尽量将工资等关键条款直接写入劳动合同文本中，避免使用补充协议等形式。如果确实需要使用补充协议，应确保补充协议与劳动合同之间存在明确的关联，并详细、明确地约定相关条款。
及时沟通协商：在签订劳动合同和补充协议前，双方应充分沟通协商，确保对工资等关键条款达成一致意见。在合同履行过程中，如需对工资进行调整或变更，也应及时通过书面形式进行确认。
寻求法律帮助：如果双方在签订或履行劳动合同过程中遇到法律问题或争议，可以及时向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见和帮助。
总结：劳动合同中不直接写工资，而是将工资条款写在协议上，这样的安排并不必然导致劳动合同无效，但可能存在一定风险。为了降低风险并保障双方权益，建议用人单位在签订劳动合同时尽量完善合同条款，并确保补充协议与劳动合同之间存在明确的关联。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。