当被告外观专利侵权并申请该专利无效时，法院通常不会直接停止审理，而是会根据具体情况决定是否中止诉讼或继续审理。以下是对这一问题的详细分析：
一、专利无效对案件审理的影响
专利无效的法律后果：
- 专利权被宣告无效后，视为自始不存在。这意味着基于该专利权的所有法律权益都将丧失，包括起诉他人侵权的权利。
对侵权诉讼的影响：
- 在专利侵权诉讼中，如果被告提出专利权无效的抗辩，并请求宣告该专利权无效，法院通常会考虑中止诉讼程序，等待专利复审委员会的审查结果。
- 如果专利权最终被宣告无效，那么原告的侵权诉讼请求将失去法律依据，法院可能会驳回原告的诉讼请求。
二、法院是否会停止审理的具体分析
一般情况下不会立即停止审理：
- 法院在受理专利侵权案件后，会按照法定程序进行审理。即使被告提出专利权无效的抗辩，法院也不会立即停止审理，而是会根据案件的具体情况，如证据的充分性、案件的复杂性等，来决定是否中止诉讼。
可能中止诉讼的情形：
- 根据《最高人民法院关于审理专利纠纷案件适用法律问题的若干规定》第九条，对于实用新型、外观设计专利权纠纷案件，如果被告在答辩期间内请求宣告该项专利权无效，且没有特定情形（如原告出具的检索报告未发现导致实用新型专利丧失新颖性、创造性的技术文献等）的，人民法院应当中止诉讼。
- 对于发明专利侵权案件，虽然法律没有明确规定必须中止诉讼，但如果被告提出专利权无效的抗辩，并提供了充分的证据支持其主张，法院也可能会考虑中止诉讼，以等待专利复审委员会的审查结果。
继续审理的情形：
- 如果法院认为被告提出的专利权无效抗辩缺乏充分证据支持，或者即使专利权存在无效的可能性，但继续审理不会对案件结果产生实质性影响，法院可能会决定继续审理。
三、后续处理与应对策略
关注专利复审委员会的审查结果：
- 无论法院是否中止诉讼，当事人都应密切关注专利复审委员会的审查结果。如果专利权被宣告无效，当事人应及时调整诉讼策略。
准备应对方案：
- 如果专利权被宣告无效，被告可以据此抗辩，要求法院驳回原告的诉讼请求。
- 如果专利权仍然有效，被告则需要进一步评估侵权风险，并考虑采取和解、反诉等措施来维护自身权益。
总结与建议：在面对被告外观专利侵权并申请该专利无效的情况时，法院的处理方式并非一成不变，而是会根据案件的具体情况来决定是否中止诉讼或继续审理。因此，作为当事人，应密切关注案件的进展和专利复审委员会的审查结果，并根据实际情况及时调整诉讼策略。如果您在此过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。