关于大型工程项目居间费超过5%是否违法的问题，不能一概而论，需要分情况讨论：

1. 居间费本身合法性：

   • 居间费，即中介费或佣金，在建设工程领域中，如果居间人（中介方）为发包方和承包方提供了订立合同的机会或者提供了订立合同的媒介服务，并促成了合同的成立，那么居间人是有权收取居间费的。这种费用是合法的，受法律保护。

2. 居间费比例的合法性：

   • 居间费的具体比例，法律并没有给出明确的上限或下限。它通常是由居间合同双方根据市场情况、服务内容、难度等因素协商确定的。
   • 如果居间费比例过高，虽然不直接违法，但可能引发一系列问题：
     • 合同效力问题：如果居间费比例过高，导致合同显失公平，可能影响合同的效力。根据《民法典》的相关规定，显失公平的合同，受损害方有权请求人民法院或者仲裁机构予以撤销。
     • 税务问题：高额的居间费可能涉及更高的税费。居间人需要按照税法规定缴纳个人所得税或企业所得税，如果逃避纳税义务，将面临税务处罚。
     • 商业贿赂风险：如果居间费被用作商业贿赂的手段，以获取不正当利益，那么这种行为是违法的，可能构成商业贿赂罪。

3. 大型工程项目居间费的特殊考虑：

   • 在大型工程项目中，由于项目规模大、金额高，居间费的比例和金额也可能相应较大。但这并不意味着可以随意设定居间费比例。
   • 双方应确保居间费比例合理，符合市场行情和行业惯例，避免引发不必要的法律纠纷。

4. 法律建议：

   • 签订书面居间合同：明确居间服务的内容、范围、期限、费用及支付方式等条款，以保障双方权益。
   • 合理设定居间费比例：根据市场情况、服务内容、难度等因素协商确定，避免过高或过低。
   • 遵守税法规定：居间人应依法缴纳税费，避免税务风险。
   • 避免商业贿赂：确保居间费的支付和收取合法合规，不涉及商业贿赂等违法行为。

总结来说，大型工程项目居间费超过5%本身并不违法，但需要确保居间费比例合理、合同合法有效、遵守税法规定并避免商业贿赂等风险。如果你在居间费方面遇到具体问题或纠纷，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。