结论：仅根据目前您所描述的情况，无法直接判断案件是否就此结束，但可以初步分析相关情况及可能走向。
一、检察院电话通知讯问的性质
检察院电话通知讯问，通常是刑事诉讼程序中的一个环节，意味着案件已经进入检察机关的审查阶段。这并不直接等同于案件的终结，而是检察机关为了进一步了解案件情况，核实证据，可能还会对犯罪嫌疑人进行讯问，以决定是否提起公诉或采取其他法律措施。
二、退获利部分的影响
您提到已经退还了获利部分，这是一个积极的举动，表明您有认罪悔罪的态度，并愿意积极配合司法机关的工作。退赃退赔在刑事案件中通常会被视为一个从轻或减轻处罚的情节，但具体效果还需结合案件的其他情况来综合判断。
三、初犯的考量
作为初犯，您没有前科记录，这也会在司法机关考虑量刑时作为一个从轻或减轻处罚的因素。然而，初犯并不意味着可以免除刑事责任，而是可能在一定程度上影响刑罚的轻重。
四、案件可能走向的分析
继续侦查与审查：检察院可能会继续对案件进行侦查和审查，包括收集更多证据、讯问其他相关人员等，以全面了解案件情况。
不起诉决定：如果检察院认为证据不足或情节轻微，可能会作出不起诉决定，此时案件将终结，您将不会被提起公诉。但这种情况需要满足一定的法律条件，并非仅凭退赃和初犯就能决定。
提起公诉：如果检察院认为证据充分、情节严重，可能会向法院提起公诉，此时案件将进入审判阶段。在审判过程中，法院将根据事实和法律作出判决。
五、建议与注意事项
积极配合司法机关：继续积极配合检察院和法院的工作，如实陈述事实，提供相关证据。
寻求法律帮助：考虑到刑事案件的复杂性和严重性，建议您尽快咨询专业律师，以便更好地了解自己的权利和义务，以及案件的可能走向。律师可以为您提供法律咨询、代理申诉、辩护等法律服务。
保持冷静与理性：面对刑事案件，保持冷静和理性至关重要。不要盲目乐观或悲观，而是要根据事实和法律来理性分析案件情况。
最后，每个刑事案件都有其独特性和复杂性，无法仅凭几个因素就准确预测案件的最终结果。因此，如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我会根据您的具体情况和案件事实，为您提供专业、全面的法律意见。