结论：在尸体已经火化的情况下，卫健委在查处非法行医时，仍然可以组织鉴定来查明死因与非法行医之间的关联，但会面临一定的挑战和限制。

分析说明：

1. 鉴定可能性：

   • 即便尸体已经火化，卫健委在查处非法行医的过程中，仍然有权力也有责任去查明死因与非法行医之间是否存在关联。这通常需要通过专业的医学鉴定来实现，比如通过审查病历资料、询问相关医护人员、进行现场勘查等方式，来尽可能还原事实真相。
   • 鉴定机构会依据现有的证据材料，如医疗记录、证人证言、现场照片等，结合医学知识和经验，对死因与非法行医的关联性进行评估和判断。

2. 面临的挑战：

   • 尸体火化后，一些直接的物证（如尸体上的伤痕、病变组织等）已经消失，这无疑增加了鉴定的难度。
   • 鉴定机构需要更加依赖其他间接证据来形成鉴定意见，这就要求证据必须充分、确凿，且能够形成完整的证据链。

3. 法律后果与责任：

   • 如果鉴定结果显示死因与非法行医存在直接关联，那么非法行医者将可能面临刑事责任的追究，同时还需要承担相应的民事赔偿责任。
   • 对于卫健委而言，如果其在查处非法行医的过程中存在疏忽或失职行为，也可能需要承担相应的行政责任或法律责任。

特别提醒：

• 在处理此类案件时，建议家属或相关当事人积极配合卫健委和鉴定机构的工作，提供尽可能多的证据材料，以便更准确地查明死因与非法行医之间的关联。
• 如果对鉴定结果有异议，可以依法申请重新鉴定或寻求其他法律救济途径。

后续行动建议：

• 如果您或您的家人遇到了类似的情况，建议尽快向当地的卫健委或公安机关报案，并保留好所有相关的证据材料。
• 同时，您也可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况，提供更详细、更专业的法律建议和帮助。