关于盖章是否要和代理人签名分开的问题，这实际上取决于具体的合同约定以及相关法律法规的要求。以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确的是，在合同签订过程中，签名和盖章都是常见的确认合同效力的方式。它们各自具有法律效力，但具体如何使用，往往需要根据合同的约定以及相关法律法规来确定。

1. 合同约定：

   • 如果合同中明确约定了“合同经双方当事人签章后生效”，但并未进一步明确是“签名”还是“盖章”，或者“签名并盖章”，那么根据一般的法律解释原则，这种“签章”的表述通常被理解为签名或盖章中的任意一种方式即可使合同生效。例如，在您提到的【金法说案】中的第一个案例，双方公司的法定代表人已在涉案合同上签字，法院即认为合同已成立并生效，并未要求再加盖公司公章。
   • 如果合同中明确约定了“合同在双方当事人签字、盖章时生效”，并且这种约定是清晰无歧义的，那么根据这种约定，合同只有在双方当事人均签字并盖章后才会生效。如【金法说案】中的第三个案例所示，由于协议上仅有甲公司法定代表人签名而未加盖公司印章，法院即认为协议未生效。

2. 法律法规要求：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。这意味着，在法律法规没有特殊规定的情况下，签名、盖章或按指印中的任意一种方式都可以使合同成立。
   • 然而，对于某些特定类型的合同或特定场合下的合同签订，法律法规可能会有更具体的要求。例如，在某些需要公证或登记的合同中，可能要求合同必须同时具备签名和盖章才能生效。

3. 实际操作建议：

   • 在签订合同时，为了避免因签名和盖章问题而产生的纠纷，建议双方当事人在合同中明确约定合同生效的条件。如果希望合同在双方签字后即生效，可以明确约定“合同经双方当事人签字后生效”；如果希望合同在双方签字并盖章后生效，则可以明确约定“合同在双方当事人签字、盖章时生效”。
   • 对于代理人签名的情况，如果代理人是代表法人或其他组织签订合同的，那么除了代理人的签名外，通常还需要加盖法人或其他组织的公章以确认合同的效力。但如果合同中已经明确约定了仅需代理人签名即可生效，或者法人或其他组织已经通过其他方式（如出具授权委托书）确认了代理人的签名效力，那么在这种情况下可能不需要再额外加盖公章。

综上所述，盖章是否要和代理人签名分开取决于合同的约定以及相关法律法规的要求。在签订合同时，建议双方当事人明确约定合同生效的条件，并遵循相关法律法规的规定进行操作。