结论：会计失职造成100万滞纳金是否需要赔偿，需结合具体情形判断，主要涉及用人单位规章制度、劳动合同约定、会计过错程度及因果关系等因素，可能存在需要赔偿、部分赔偿或无需赔偿三种情况。以下分情况详细说明：

1. 若用人单位规章制度或劳动合同明确约定会计失职的赔偿责任，且会计存在重大过失或故意

根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。若用人单位的规章制度（需经民主程序制定并公示）或劳动合同中明确约定“会计因失职导致滞纳金等损失需承担赔偿责任”，且会计的失职行为被认定为重大过失或故意（如故意隐瞒税务风险、未履行基本核对义务等），则会计可能需要赔偿全部或部分滞纳金。
关键点：

• 规章制度需合法有效（内容合法、程序民主、公示告知）；
  
• 会计的过错需达到“重大过失”或“故意”程度（普通疏忽一般不构成赔偿依据）；
  
• 赔偿金额通常以会计当月工资的20%为限（剩余部分可协商或通过其他途径追偿，但需符合《劳动合同法》关于赔偿的限制性规定）。

2. 若用人单位无明确约定，或会计仅存在一般过失

若用人单位未在规章制度或劳动合同中约定赔偿责任，或会计的失职行为属于一般过失（如因经验不足、操作疏忽但已履行基本注意义务），则会计通常无需赔偿滞纳金。此时，滞纳金属于用人单位的经营风险，应由用人单位自行承担。
法律依据：

• 根据《劳动合同法》第二十九条，用人单位与劳动者应当按照劳动合同的约定，全面履行各自的义务。若未约定赔偿，用人单位无权单方面要求劳动者承担损失；
  
• 劳动法律对劳动者赔偿采取“严格限制”原则，仅在劳动者存在故意或重大过失时才可能承担责任。

3. 若滞纳金产生与会计失职无直接因果关系

即使会计存在失职行为，但若滞纳金的产生与会计行为无直接因果关系（如因用人单位决策失误、其他部门未提供准确数据等），则会计无需赔偿。例如，税务申报延迟是因财务总监未审批文件，而非会计未提交申报表，此时会计不承担责任。
关键点：

• 需证明滞纳金与会计失职之间存在直接、必然的因果关系；
  
• 若存在多因一果（如会计失职+系统故障共同导致），可能按过错比例分担责任。

实务建议

1. 对用人单位：若希望会计承担赔偿责任，需在规章制度或劳动合同中明确约定赔偿情形、范围及程序，并确保制度合法有效；
   
2. 对会计：若被要求赔偿，可核查用人单位的规章制度是否合法、自身过错程度及因果关系，必要时通过劳动仲裁维护权益；
   
3. 协商优先：双方可协商赔偿比例（如按工资比例分摊），避免诉讼成本。

如有进一步细节（如规章制度内容、会计具体失职行为等），可继续向我咨询，我会结合具体情形为您分析。