关于农村土地面积是按确权证算还是按合同本算的问题，这实际上涉及到了土地确权过程中的面积计算与确认原则。以下是我为您提供的详细解答：

一、土地确权证面积的计算原则

土地确权证上的面积计算是一个综合实际测量与合同面积，并遵循相关法律法规和程序要求的严谨过程。在确权过程中，会同时考虑“承包地二轮合同面积”和“实际测量面积”。

1. 实际测量法：

   • 对于耕地等农用地，会根据土地形状采用不同的测量方法。规则形状的土地（如长方形）会使用长×宽的公式进行计算；不规则形状的土地则会采用分割法或填补法转化为规则图形后再进行计算。此外，还可以使用GPS测量仪或全站仪等高精度测量工具进行测量。
   • 宅基地面积的计算则通常基于房屋建筑占地及附属用地范围，方法与农用地类似，但需注意地区特殊规定，如建筑层数和人均面积标准。
   • 实际测量的面积会经过公示和审核程序，确保数据准确公正后，据实登记在土地确权证书上。

2. 合同面积参考：

   • 在土地确权时，会同时记录“承包地二轮合同面积”和“实际测量面积”。如果实测面积与合同面积有出入，会在登记簿中注明，并在满足一定误差范围（如不超过5%）内，依据本次土地确权查实结果据实登记。
   • 如果二轮合同面积因地块等级进行了折亩计算，也会在登记簿中明确标注。

二、面积确认的优先级

在土地确权过程中，实际测量面积通常具有更高的优先级。这是因为实际测量能够更准确地反映土地的真实状况，避免因合同面积与实际面积不符而引发的纠纷。然而，如果实测面积与合同面积在误差范围内，且双方无异议，那么也可以按照合同面积进行确认。

三、注意事项

1. 数据审核与公示：

   • 如果实测面积与合同面积存在较大出入，需要对土地地籍草图进行审核，并进行实地勘测以验证数据真实性。
   • 审核后的数据应在村、组进行公示，确保公开透明，无异议后方可进行确权登记。

2. 面积误差处理：

   • 如果面积误差在3%以内，通常属于正常范围，可以采取多退少补的方式处理。
   • 如果面积误差超出3%，则可能涉及退房、补齐差价或其他依法依规的处理方式。

3. 特殊情况处理：

   • 如果农民在上报土地亩数时少报，确权时应予更正，按原有土地亩数核查统计。
   • 如果农民对测量数据有异议，有权要求重新测量，并确保其权益不受损害。

四、综合分析

土地确权证上的面积计算不仅关乎农民的切身利益，也是土地管理和利用的重要基础。因此，在确权过程中必须严格遵循相关法律法规和程序要求，确保测量数据的准确性和公正性。在实际操作中，应结合实际情况灵活运用不同的测量方法和技术手段，同时加强数据审核和公示环节，确保土地确权工作的顺利进行。

综上所述，农村土地面积在确权时通常以实际测量面积为准，但也会参考合同面积。如果实测面积与合同面积在误差范围内且双方无异议，也可以按照合同面积进行确认。在处理面积误差和特殊情况时，应依法依规妥善处理，维护农民的合法权益和社会稳定。