结论：政府的合法招商项目租赁合法仓库后，若招商项目违法，一般情况下对房东没有直接影响，但具体还需根据房东是否知情、是否参与以及租赁合同的具体约定等因素来综合判断。以下从不同角度为您详细分析：

1. 房东不知情且未参与违法活动：

   • 法律背景：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，租赁合同是出租人（房东）与承租人（招商项目方）之间设立、变更、终止租赁关系的协议。若房东对招商项目的违法行为不知情，且未以任何形式参与或协助该违法行为，那么房东通常不需要承担法律责任。
   • 法律建议：房东应保留好租赁合同、租金收据等相关证据，以证明自己对招商项目的违法行为不知情且未参与。同时，房东可以积极配合相关部门的调查，提供必要的协助和信息。

2. 房东知情但未参与违法活动：

   • 法律背景：如果房东知道招商项目存在违法行为，但并未直接参与或协助该违法行为，房东的法律责任可能相对较轻。然而，房东可能因未履行报告义务或未采取合理措施防止违法行为发生而承担一定的法律责任，具体取决于相关法律法规的规定和案件的具体情况。
   • 法律建议：房东在发现招商项目存在违法行为时，应及时向相关部门报告，并采取合理措施防止违法行为继续发生。同时，房东应保留好相关证据，以证明自己已尽到合理的注意义务。

3. 房东参与违法活动：

   • 法律背景：如果房东不仅知情，还以任何形式参与或协助了招商项目的违法行为，那么房东将可能面临法律责任。根据违法行为的性质和严重程度，房东可能面临行政处罚、民事赔偿甚至刑事责任。
   • 法律建议：房东应立即停止参与任何违法行为，并积极配合相关部门的调查。同时，房东应咨询专业律师，了解自己的法律责任和可能的法律后果，以便采取合适的应对措施。

4. 租赁合同的具体约定：

   • 法律背景：租赁合同中可能包含关于招商项目违法行为的处理条款。如果合同中有明确约定，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么双方应按照合同约定履行各自的权利和义务。
   • 法律建议：房东应仔细审查租赁合同中的相关条款，了解自己在招商项目违法行为发生时的权利和义务。如果合同中有不明确或存在争议的地方，房东应及时与承租人协商解决，或咨询专业律师的意见。

可能法律后果：

• 若房东不知情且未参与违法活动，通常不会承担法律责任。
• 若房东知情但未参与违法活动，可能因未履行报告义务或未采取合理措施而承担一定的法律责任。
• 若房东参与违法活动，将可能面临行政处罚、民事赔偿甚至刑事责任。

进一步思考：

• 房东在出租仓库时，应加强对承租人的资质审查和背景调查，以降低租赁风险。
• 房东应定期与承租人沟通，了解招商项目的运营情况，及时发现并处理潜在的法律问题。
• 在签订租赁合同时，房东应明确约定关于招商项目违法行为的处理条款，以保障自己的合法权益。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。