结论：法人没变、实际控制人没变，仅企业负责人变更，并不直接导致超期定点药店协议解除。协议是否解除需依据协议中的具体条款以及相关法律法规进行综合判断。
分析：
协议条款的约定：
- 首先，需要审查超期定点药店协议中是否有关于企业负责人变更导致协议解除的明确条款。如果协议中有此类条款，并且该条款不违反法律法规的强制性规定，那么企业负责人的变更可能会触发协议的解除条件。
- 如果协议中没有此类条款，或者条款表述模糊、不明确，那么企业负责人的变更通常不会直接导致协议的解除。
法律法规的适用：
- 在没有协议明确约定的情况下，需要依据相关法律法规来判断企业负责人变更是否构成协议解除的合法理由。
- 一般来说，企业负责人的变更属于公司内部管理事项，除非该变更直接影响到协议的履行（如企业负责人是协议履行的关键人物，且其变更导致协议无法继续履行），否则通常不会构成协议解除的合法理由。
实际控制人和法人的稳定性：
- 题目中明确提到法人没变、实际控制人没变，这表明公司的法律主体和实际控制权并未发生变更。
- 在这种情况下，企业负责人的变更更可能被视为公司内部管理层的调整，而不影响公司的整体运营和协议的履行。
可能的法律后果：
- 如果企业负责人变更被错误地视为协议解除的理由，并且一方因此采取了不当行动（如单方面解除协议），那么该方可能需要承担违约责任，包括赔偿对方因此遭受的损失。
建议：
- 审查协议条款：首先，建议双方仔细审查超期定点药店协议中的相关条款，特别是关于协议解除的条件和程序。
- 协商沟通：如果企业负责人的变更确实对协议的履行产生了影响，双方应积极协商沟通，寻求妥善的解决方案，如修改协议条款、调整履行方式等。
- 寻求法律帮助：如果双方无法就协议解除问题达成一致意见，或者一方认为另一方的行为构成违约，建议及时寻求专业律师的法律帮助，以维护自身的合法权益。
总结：企业负责人的变更并不直接导致超期定点药店协议的解除，协议是否解除需依据协议条款和法律法规进行综合判断。在处理此类问题时，建议双方保持冷静、理性沟通，并寻求专业律师的法律支持。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。