股东对公司法定代表人与实际施工人的结算有异议时，结算的效力需根据具体情况来判断。以下是对此问题的详细分析：

1. 结算行为的法律效力基础：

   • 法定代表人的行为：根据《中华人民共和国公司法》及相关法律规定，公司法定代表人有权代表公司进行民事活动，包括签订合同、进行结算等。因此，法定代表人与实际施工人进行的结算行为，在一般情况下，是代表公司进行的，具有法律效力。
   • 股东异议的提出：股东作为公司的投资者，对公司经营有监督权。若股东认为法定代表人与实际施工人的结算行为存在问题，如结算金额不实、结算程序违法等，可以提出异议。

2. 股东异议对结算效力的影响：

   • 异议成立的情况：如果股东能够提供充分证据证明结算行为存在违法或不当之处，如结算金额与实际工程量不符、结算程序违反公司章程或法律规定等，那么该结算行为可能被认定为无效或可撤销。此时，公司可以拒绝承认该结算结果，并寻求法律途径解决争议。
   • 异议不成立的情况：如果股东提出的异议缺乏充分证据支持，或者结算行为本身符合法律规定和公司章程，那么该结算行为仍然有效。股东不能仅凭个人意见或怀疑就否定结算的效力。

3. 法律程序与救济途径：

   • 内部解决：股东可以先通过公司内部程序，如召开股东会或董事会，对结算行为进行审议和表决。如果内部程序能够解决问题，那么可以避免法律纠纷。
   • 法律诉讼：如果内部程序无法解决问题，股东可以向法院提起诉讼，要求确认结算行为的效力或撤销结算行为。在诉讼过程中，股东需要提供充分证据证明自己的主张。

4. 实际建议：

   • 保留证据：股东在提出异议前，应尽可能收集并保留与结算行为相关的证据，如合同、结算单、工程量清单等。这些证据将有助于证明结算行为的合法性和合理性。
   • 咨询专业律师：在处理此类纠纷时，股东可以咨询专业律师的意见。律师将根据具体情况提供法律建议和解决方案，帮助股东维护自己的合法权益。

总结来说，股东对公司法定代表人与实际施工人的结算有异议时，结算的效力并非绝对有效或无效，而是需要根据具体情况来判断。股东应通过合法途径提出异议，并提供充分证据支持自己的主张。如有需要，可以寻求专业律师的帮助来维护自己的权益。