结论：在男方服刑且有两个未成年孩子（其中一个未满八岁）的情况下起诉离婚，孩子的抚养权判决会综合考虑多个因素，但未满八周岁的子女原则上会判给母亲直接抚养，另一子女的抚养权则需根据双方具体情况和子女利益最大化原则来判定。
一、关于未满八周岁子女的抚养权
根据《中华人民共和国民法典》第一千零八十四条的规定，离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。虽然此条款直接提及的是不满两周岁的子女，但在司法实践中，对于未满八周岁的子女，法院通常会倾向于考虑其年龄较小、更需要母亲照顾的特点，因此，在男方服刑的情况下，未满八周岁的子女原则上会判给母亲直接抚养。
二、关于另一子女的抚养权
对于另一个已满八周岁的子女，其抚养权的判决则不再单纯依据年龄，而是会综合考虑以下因素：
双方的经济条件：法院会评估双方的经济状况，包括收入、财产等，以确定哪一方更有能力为子女提供稳定的生活环境和良好的教育条件。
双方的生活环境：法院会考虑双方的生活环境，包括居住条件、社区环境等，以判断哪一方更适合子女居住和成长。
子女的意愿：如果子女已满八周岁，法院在判决抚养权时，会尊重子女的真实意愿，询问子女愿意与哪一方共同生活。
双方的抚养能力和抚养条件：法院会评估双方的抚养能力和抚养条件，包括是否有时间照顾子女、是否有教育子女的能力等。
男方服刑的情况：由于男方正在服刑，其无法亲自照顾子女，这将在很大程度上影响法院对其抚养能力的评估。
在综合考虑以上因素后，法院会本着子女利益最大化的原则来判定另一子女的抚养权归属。如果母亲具备更好的抚养条件和抚养能力，且子女也愿意与母亲共同生活，那么法院很可能会将另一子女的抚养权也判给母亲。
三、特殊情况下的抚养权判决
如果母亲存在不利于子女成长的情形，如虐待、遗弃子女，或者患有严重疾病无法照顾子女等，法院可能会考虑将子女的抚养权判给其他适合的监护人，如祖父母、外祖父母等。但在本题中，并未提及母亲存在此类不利情形，因此这种情况较为罕见。
四、建议
收集证据：如果母亲希望获得两个子女的抚养权，应收集相关证据证明自己的抚养能力和抚养条件优于男方，如收入证明、居住证明、教育计划等。
尊重子女意愿：如果子女已满八周岁，应与子女进行沟通，了解其真实意愿，并在法庭上尊重子女的选择。
寻求法律帮助：由于抚养权判决涉及多个复杂因素，建议母亲在起诉前咨询专业律师，了解自己的权利和义务，以及法院可能的判决结果。
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