结论：要撰写一份关于父亲的房子归小儿子所有，另外两兄弟没有的协议，关键在于确保协议内容合法、明确且各方自愿签署。以下是一份协议的基本框架和要点说明，供您参考。

协议基本框架

1. 标题：明确协议的性质，如“房产归属协议”。

2. 协议双方：列出父亲及三个儿子的全名、身份证号码等基本信息。

3. 房产信息：详细描述房产的具体信息，包括但不限于房产地址、房产证号、面积等。

4. 房产归属声明：

   • 明确声明该房产归小儿子所有，另外两兄弟不享有任何权益。
   • 可以说明这一决定是基于父亲的意愿、家庭协商或其他合理原因。

5. 各方权利与义务：

   • 父亲应确保房产的合法性，无任何产权纠纷或抵押情况。
   • 小儿子应承担房产的后续管理、维护等责任（如适用）。
   • 另外两兄弟应放弃对该房产的所有权利，并不得对此提出任何异议或要求。

6. 违约责任：

   • 约定如果任何一方违反协议内容，应承担的法律责任，如赔偿损失、支付违约金等。

7. 争议解决方式：

   • 约定如果发生争议，应首先通过友好协商解决；协商不成的，可以提交至有管辖权的人民法院诉讼解决。

8. 协议生效与变更：

   • 明确协议自双方签字（或盖章）之日起生效。
   • 约定协议的变更或解除需经双方协商一致，并书面确认。

9. 其他条款：

   • 可以根据实际情况添加其他必要的条款，如保密条款、通知条款等。

10. 签字（或盖章）与日期：

    • 协议双方应在协议末尾签字（或盖章），并注明签署日期。

示例条款

房产归属声明： “甲方（父亲）自愿将其名下的位于[房产地址]的房产（房产证号：[房产证号]）归乙方（小儿子）所有，丙方（大儿子）和丁方（二儿子）对此无异议，并放弃对该房产的所有权利。”

违约责任： “如任何一方违反本协议约定，应向守约方支付违约金人民币[具体金额]元，并赔偿因此给守约方造成的一切损失。”

注意事项

1. 合法性：确保协议内容不违反法律法规的强制性规定，如公序良俗、税收法规等。

2. 明确性：协议内容应具体、明确，避免使用模糊或歧义的表述。

3. 自愿性：协议各方应在充分了解协议内容的基础上自愿签署，不得存在欺诈、胁迫等情形。

4. 公证与登记：如果可能的话，建议对协议进行公证或向相关部门进行登记，以增强协议的法律效力。

5. 专业咨询：在签署协议前，建议各方咨询专业律师或法律顾问，以确保协议的合法性和有效性。

如果您在撰写或签署协议过程中遇到任何问题，或者需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。