农村建房合法手续的办理是一个涉及多个环节和部门的流程，下面我将为您详细介绍整个流程：
一、申请主体与条件
首先，需要明确的是，农村宅基地的申请主体应为农村的户，而非村民个人。申请宅基地的农户需要满足一定的条件，包括但不限于：
- 申请人是本集体经济组织成员；
- 因基础建设和村镇建设规划用地搬迁、拆迁，需要重新安排宅基地的；
- 原房屋破旧、宅基地面积小于法定面积，需翻建、扩建的；
- 多子女家庭，有子女已达婚龄，确需分家另行建房的；
- 因原宅基地存在地质滑坡、泥石流隐患的；
- 经批准，户口由外地迁入本集体经济组织而无住房的。
二、申请流程
提出书面申请：
- 符合宅基地申请条件的农户，以户为单位向所在村民小组提出宅基地和建房（规划许可）书面申请。
- 若没有分设村民小组或宅基地和建房申请等事项已统一由村级组织办理，则农户直接向村级组织提出申请。
村民小组会议讨论并公示：
- 村民小组收到申请后，应提交村民小组会议讨论，并将申请理由、拟用地位置和面积、拟建房层高和面积等情况在本小组范围内公示。
- 公示无异议或异议不成立的，村民小组将农户申请、村民小组会议记录等材料交村集体经济组织或村民委员会（以下简称村级组织）审查。
村级组织审查：
- 村级组织重点审查提交的材料是否真实有效、拟用地建房是否符合村庄规划、是否征求了用地建房相邻权利人意见等。
- 审查通过的，由村级组织签署意见，报送乡镇政府。
乡（镇）政府受理与联审联办：
- 乡镇政府应建立一个窗口对外受理、多部门内部联动运行的农村宅基地用地建房联审联办制度。
- 农业农村部门负责审查申请人是否符合申请条件、拟用地是否符合宅基地合理布局要求和面积标准等。
- 自然资源部门负责审查用地建房是否符合国土空间规划、用途管制要求等。
- 涉及林业、水利、电力等部门的要及时征求意见。
乡（镇）政府审批：
- 根据各部门联审结果，由乡镇政府对农民宅基地申请进行审批，出具《农村宅基地批准书》。
- 鼓励地方将乡村建设规划许可证由乡镇一并发放，并以适当方式公开。
报县政府备案：
- 乡镇要建立宅基地用地建房审批管理台账，有关资料归档留存，并及时将审批情况报县级农业农村、自然资源等部门备案。
三、宅基地审核批准的“三到场”
宅基地申请审查到场：
- 乡镇政府在收到申请后，应组织相关部门到现场进行实地审查，确认申请人是否符合条件，拟用地是否符合规划等。
批准后丈量批放到场：
- 经批准用地建房的农户，应当在开工前向乡镇政府或授权的牵头部门申请划定宅基地用地范围。
- 乡镇政府及时组织农业农村、自然资源等部门到现场进行开工查验，实地丈量批放宅基地，确定建房位置。
住宅建成后核查到场：
- 农户建房完工后，乡镇政府组织相关部门进行验收。
- 实地检查农户是否按照批准面积、四至等要求使用宅基地，是否按照批准面积和规划要求建设住房，并出具《农村宅基地和建房（规划许可）验收意见表》。
四、办理宅基地使用权登记
通过验收的农户，可以向不动产登记部门申请办理不动产登记。申请宅基地使用权登记的主体为用地批准文件记载的宅基地使用权人。申请时需要提交的材料包括申请人身份证和户口簿、不动产权属证书或者有批准权的人民政府批准用地的文件等权属来源材料、房屋符合规划的证明等。
整个流程下来，虽然涉及多个环节和部门，但只要按照规定的程序和要求进行申请和审批，就可以合法合规地在农村建房了。希望这些信息能对您有所帮助！