结论：跨县区携带一只狗是否违反《动物防疫法》，需根据具体情况判断，主要涉及是否依法办理检疫手续、是否来自疫区或携带病原体等因素。以下从不同角度详细分析：

1. 若狗已依法办理检疫手续，且非来自疫区或携带病原体

• 法律依据：根据《动物防疫法》第五十二条，经航空、铁路、道路、水路运输动物和动物产品的，托运人托运时应当提供检疫证明；没有检疫证明的，承运人不得承运。
  
• 分析：若您已为狗办理了有效的检疫证明（如《动物检疫合格证明》），且狗未被列入疫区名单或未携带病原体（如狂犬病、细小病毒等），则跨县区携带不违法。
  
• 建议：运输前确认检疫证明在有效期内（通常为3-5天），并保留好证明文件以备查验。

2. 若狗未办理检疫手续，或来自疫区/携带病原体

• 法律依据：
  
  • 《动物防疫法》第五十一条：屠宰、经营、运输的动物，以及用于科研、展示、演出和比赛等非食用性利用的动物，应当附有检疫证明。
    
  • 第九十七条：违反本法规定，有下列行为之一的，由县级以上地方人民政府农业农村主管部门责令改正，处一千元以上一万元以下罚款；情节严重的，责令停业整顿，并处一万元以上十万元以下罚款：……（三）未按照规定处理或者随意弃置病死动物、病害动物产品的；（四）销售、运输未附有检疫证明的动物、动物产品的。
    
• 分析：
  
  • 若未办理检疫证明，属于违法行为，可能面临罚款（1000元至1万元）。
    
  • 若狗来自疫区（如发生狂犬病、非洲猪瘟等疫情的地区）或携带病原体，除罚款外，还可能被强制隔离、无害化处理，甚至追究刑事责任（如构成妨害动植物防疫、检疫罪）。
    
• 建议：立即补办检疫手续，或联系当地农业农村部门咨询具体要求。

3. 特殊情形：宠物狗的运输要求

• 补充规定：部分地区对宠物运输有额外要求（如佩戴嘴套、使用专用运输箱等），需遵守当地规定。
  
• 分析：即使狗有检疫证明，若未满足运输工具或防护措施要求，仍可能被认定为违规。
  
• 建议：运输前查询目的地县区的具体规定（如通过当地政府官网或农业农村部门电话咨询）。

4. 法律后果总结

• 合法情形：有检疫证明+非疫区狗→不违法。
  
• 违法情形：
  
  • 无检疫证明→罚款1000元至1万元。
    
  • 来自疫区或携带病原体→罚款+强制措施（隔离、无害化处理）+可能的刑事责任。
    

进一步建议：

1. 运输前通过“中国动物疫病预防控制中心”官网或当地农业农村部门确认狗的检疫状态。
   
2. 保留运输过程中的相关凭证（如检疫证明、运输合同等），以备纠纷时使用。
   
3. 若遇到执法部门查验，积极配合并提供证明文件，避免冲突。
   

如有其他细节需要进一步分析（如狗的品种、运输方式等），可直接向我咨询。