关于您提出的“合作社的章能不能盖在毕业生就业协议书上”的问题，这主要取决于合作社的性质以及您与合作社之间的实际就业关系。以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确就业协议书（俗称“三方协议”）的基本性质和作用。就业协议书是为明确毕业生、用人单位、毕业生所在学校三方在毕业生就业工作中的权利和义务，经协商签订的协议。它具有一定的广泛性和权威性，对签约的三方都有约束力。
接下来，我们分析合作社的章是否适用于就业协议书：
合作社的性质：
- 如果合作社是一个具有独立法人资格、能够承担民事责任的经济组织，并且您与合作社之间存在真实的就业关系（如您已被合作社录用为正式员工），那么合作社的章在理论上是可以盖在就业协议书上的。
就业关系的真实性：
- 就业协议书的核心是确认毕业生与用人单位之间的就业关系。因此，在盖章之前，您需要确保与合作社之间已经建立了真实的就业关系，包括签订了正式的劳动合同或达成了明确的录用意向。
学校的审核要求：
- 就业协议书通常需要经过学校的审核。学校在审核时，会关注用人单位的合法性、就业关系的真实性以及协议内容的合规性。因此，即使合作社的章在法律上是有效的，但如果学校认为合作社不符合其审核标准（如规模、行业性质等），也可能拒绝接受该协议。
实际操作建议：
- 在决定使用合作社的章之前，建议您先与学校就业指导中心或相关部门进行沟通，了解学校对用人单位的具体要求和审核标准。
- 同时，您也可以与合作社进行协商，确认其是否愿意并能够按照学校的要求提供必要的证明材料（如营业执照、税务登记证等）。
综上所述，合作社的章能否盖在毕业生就业协议书上，取决于合作社的性质、您与合作社之间的就业关系真实性以及学校的审核要求。为了确保协议的合法性和有效性，建议您在盖章前与学校和合作社进行充分沟通，并按照学校的要求提供必要的证明材料。