结论：在专业工程暂估价中，若由甲方直接招标，是否可以直接与甲方签合同，这并非一个绝对的问题，而是取决于具体的招标文件规定、合同条款以及相关法律法规的适用情况。以下从不同角度进行分析：

1. 招标文件与合同条款的约定：

   • 招标文件规定：招标文件是招标活动的法律性文件，其中会明确规定招标范围、中标条件、合同签订方式等关键内容。如果招标文件明确规定，专业工程暂估价部分由甲方直接招标，并且中标单位需直接与甲方签订合同，那么在这种情况下，是可以直接与甲方签合同的。
   • 合同条款约定：即使招标文件没有明确规定，但如果后续签订的合同中明确约定了专业工程暂估价部分由中标单位直接与甲方签订合同，那么这一约定也是具有法律效力的，双方应遵守执行。

2. 相关法律法规的适用：

   • 《中华人民共和国招标投标法》：该法规定了招标投标活动的基本原则和程序，但并未直接规定专业工程暂估价部分必须由谁签订合同。因此，在遵守该法的前提下，合同签订方式可以由招标文件或合同条款进行约定。
   • 《中华人民共和国合同法》（现《中华人民共和国民法典》合同编）：该法规定了合同的基本原则和签订、履行、变更、解除等规则。在签订专业工程暂估价合同时，应遵守该法的相关规定，确保合同的合法性和有效性。如果合同条款与法律法规相抵触，则相关条款可能被认定为无效。

3. 实际操作中的考虑因素：

   • 甲方意愿与中标单位协商：在实际操作中，甲方和中标单位可以通过协商确定合同签订方式。如果双方达成一致意见，且该意见不违反法律法规和招标文件的规定，那么是可以直接与甲方签合同的。
   • 工程管理与协调：从工程管理和协调的角度来看，如果专业工程暂估价部分由甲方直接招标并签订合同，可能更有利于甲方对整个工程项目的统一管理和协调。但这并不是决定性的因素，还需要考虑其他方面的因素，如合同条款的公平性、中标单位的资质和信誉等。

法律建议：

• 在参与专业工程暂估价招标时，应仔细阅读招标文件，了解招标范围、中标条件、合同签订方式等关键内容。
• 在签订合同时，应确保合同条款明确、具体，且不违反法律法规和招标文件的规定。
• 如果对合同签订方式存在疑问或争议，应及时与甲方进行沟通协商，寻求解决方案。
• 在整个招标和合同签订过程中，应遵守相关法律法规的规定，确保活动的合法性和有效性。

可能后果：

• 如果违反招标文件或合同条款的规定签订合同，可能导致合同无效或被撤销，给双方带来不必要的法律风险和经济损失。
• 如果未遵守相关法律法规的规定进行招标和合同签订活动，可能面临行政处罚或法律责任。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。