村经济合作社能否在发改部门备案建房，需分情况讨论，核心取决于建房用途、土地性质及是否符合法定程序，具体分析如下：

1. 若建房用途为集体经营性建设用地开发（如商业、工业用途）

• 合法性前提：需满足《土地管理法》第60条及《集体经营性建设用地入市试点办法》规定，即：
  • 土地性质为集体经营性建设用地（需通过土地利用总体规划、城乡规划确定为工业、商业等经营性用途）；
  • 需经本集体经济组织成员的村民会议三分之二以上成员或三分之二以上村民代表同意；
  • 需通过土地所有权人（村集体）以出让、出租等方式交由村经济合作社使用，并签订书面合同；
  • 需在县级自然资源主管部门办理用地手续，并在发改部门备案（备案需提交用地批准文件、规划许可等材料）。
• 结论：若符合上述条件，村经济合作社可在发改部门备案建房，合法。

2. 若建房用途为农村公益事业或公共设施（如村卫生室、文化站）

• 合法性前提：需依据《土地管理法》第61条，由村集体申请使用集体建设用地（非经营性），并经乡镇政府审核、县级政府批准；
• 备案要求：此类项目通常需在发改部门办理立项备案（需提交用地批准文件、规划许可、可行性研究报告等），但备案主体一般为村集体或乡镇政府，而非村经济合作社直接备案；
• 结论：村经济合作社可参与建设，但备案主体需符合规定，需以村集体名义申请并经政府批准后方可备案。

3. 若建房用途为村民住宅（如集中建房）

• 合法性前提：需依据《土地管理法》第62条，占用集体建设用地的，需经乡镇政府审核、县级政府批准；占用农用地的，需依法办理农用地转用审批手续；
• 备案要求：村民住宅建设通常由村民个人或村集体申请规划许可和施工许可，发改部门备案非强制程序（除非涉及政府投资或需立项的项目）；
• 结论：村经济合作社一般不直接备案村民住宅建设，除非作为项目业主代为申请（需符合地方政策）。

4. 关键风险提示

• 土地性质不符：若在农用地上建房（未办理转用审批），即使备案也属违法用地，可能面临拆除、罚款等处罚；
• 程序瑕疵：未履行村民会议决议、未取得规划许可等，可能导致备案无效或行政处罚；
• 主体不适格：村经济合作社需有独立法人资格（如登记为农民专业合作社或经济联合社），否则无法作为备案主体。

建议行动

1. 核实土地性质：通过当地自然资源局查询土地规划用途（如集体建设用地、农用地等）；
2. 确认建房用途：明确项目性质（经营性、公益性或住宅），对应不同审批流程；
3. 完善决策程序：召开村民会议或代表会议，形成书面决议；
4. 咨询当地部门：发改、自然资源、住建等部门对备案要求可能有细化规定，建议提前沟通。

如有进一步细节（如土地证号、项目规划等），可提供更多信息以便针对性分析。