汽车维修企业环保措施不合格，一般由生态环境主管部门进行处罚。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 处罚主体：

   • 根据《中华人民共和国环境保护法》及相关地方性环保法规，生态环境主管部门（如环保局）是负责监督企业环保措施执行情况的主要机构。当汽车维修企业的环保措施不合格时，生态环境主管部门有权对其进行处罚。

2. 处罚依据：

   • 处罚的依据主要包括企业是否违反了环保法规、排放标准或未按照规定采取环保措施等。例如，如果企业未按照规定安装或使用污染治理设施，或者排放的污染物超过了国家或地方规定的排放标准，都可能成为处罚的依据。

3. 处罚措施：

   • 生态环境主管部门在发现企业环保措施不合格后，可能会采取一系列处罚措施，包括但不限于警告、罚款、责令停产整治、吊销排污许可证等。具体的处罚措施会根据违法行为的性质、情节以及造成的后果等因素来决定。

4. 企业应对与合规建议：

   • 对于汽车维修企业而言，为了避免因环保措施不合格而受到处罚，应当积极采取合规措施。这包括但不限于安装并正常运行污染治理设施、定期监测并报告污染物排放情况、加强员工环保培训等。
   • 如果企业收到生态环境主管部门的处罚通知，应当及时了解处罚的具体原因和依据，并积极配合整改。在整改过程中，企业可以寻求专业环保咨询机构的帮助，以确保整改措施的有效性和合规性。

5. 法律后果与风险防范：

   • 如果企业忽视环保法规，长期不采取有效措施改善环保状况，可能会面临更严重的法律后果，如被责令停产整治、吊销营业执照等。这不仅会影响企业的正常运营，还可能对企业的声誉和长期发展造成不利影响。
   • 因此，汽车维修企业应当高度重视环保工作，建立健全环保管理制度，加强环保设施的建设和维护，确保企业的环保措施符合法规要求。

在实际操作中，如果汽车维修企业遇到环保措施不合格被处罚的情况，或者对环保法规有任何疑问，都可以直接向我咨询。我会根据企业的具体情况，提供专业的法律意见和合规建议。