针对一般干部多年收取商人三万多元贿赂的情况，结合我国现行法律规定，处理方式如下：

1. 构成受贿罪，依法追究刑事责任
   根据《中华人民共和国刑法》第三百八十五条，国家工作人员利用职务上的便利，索取他人财物或非法收受他人财物，为他人谋取利益的，构成受贿罪。本案中，该干部作为国家工作人员（一般干部属于国家工作人员范畴），长期收受商人贿赂3万余元，已达到受贿罪的立案标准（根据司法解释，受贿数额在3万元以上或2万元以上+特定情节的，应予立案）。因此，其行为已涉嫌刑事犯罪，需承担刑事责任。

2. 量刑标准与情节考量
   根据《刑法》第三百八十六条及司法解释，受贿数额在3万元以上不满20万元的，属于“数额较大”，依法应处三年以下有期徒刑或拘役，并处罚金。但若存在以下情节，可能从重处罚：

   • 多次受贿（如本案中“多年收取”）；
     
   • 为商人谋取不正当利益；
     
   • 造成公共财产、国家和人民利益重大损失；
     
   • 曾因职务违法受过处分等。
     若存在自首、立功、退赃等情节，则可能从轻或减轻处罚。

3. 党纪政务处分同步进行
   除刑事责任外，该干部作为党员干部或公职人员，还需接受党纪政务处分。根据《中国共产党纪律处分条例》及《中华人民共和国公职人员政务处分法》，受贿行为可能面临开除党籍、开除公职等顶格处分，且处分决定会抄送司法机关，作为量刑参考。

4. 追缴违法所得
   根据《刑法》第六十四条，犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或责令退赔。因此，该干部收取的3万余元贿赂款需全额上缴国库。

建议与提醒：
若您是涉案干部或其家属，建议尽快委托律师介入，争取通过退赃、自首等情节争取从宽处理；若您是举报人或相关方，可依法向纪检监察机关或检察院举报，并提供证据材料。具体案件处理需结合证据细节，如有进一步疑问，可直接向我咨询。