结论概述：在犯罪嫌疑人潜逃的情况下，公安移送案款3600万，法院刑事判决2200万，对于剩下的1400万，其处理方式主要取决于该款项的性质、来源以及法院的判决内容。以下从几个可能的角度进行分析：

1. 款项性质与来源：

   • 如果这1400万是犯罪嫌疑人的合法财产，且与犯罪行为无直接关联，那么这部分财产原则上不应被没收或追缴。法院在判决时，应当明确区分犯罪所得与合法财产，确保合法财产不受侵犯。
   • 如果这1400万是犯罪所得或用于犯罪活动的财物，根据《中华人民共和国刑法》第六十四条的规定，犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或者责令退赔；对被害人的合法财产，应当及时返还；违禁品和供犯罪所用的本人财物，应当予以没收。没收的财物和罚金，一律上缴国库，不得挪用和自行处理。因此，这部分财产可能会被法院依法追缴或没收。

2. 法院判决内容：

   • 法院在判决时，会明确指出需要追缴或没收的财产范围。如果判决中明确指出了需要追缴或没收的财产金额，且该金额小于公安移送的案款总额，那么剩余的部分可能会根据具体情况进行处理，如返还给合法所有人、上缴国库或作为其他法律程序的执行标的。
   • 如果法院判决中未明确提及剩余款项的处理方式，那么这部分款项可能会暂时由公安机关或法院保管，等待进一步的处理决定。在这种情况下，相关机关会根据法律规定和案件具体情况，作出合理的处理安排。

3. 潜逃犯罪嫌疑人的处理：

   • 对于潜逃的犯罪嫌疑人，公安机关会继续追捕，并尽力追回其违法所得。如果犯罪嫌疑人最终被抓获并接受审判，法院会根据其犯罪事实和法律规定，对其违法所得进行追缴或没收。
   • 在犯罪嫌疑人潜逃期间，如果其违法所得已经被公安或法院控制，那么这部分财产将按照上述原则进行处理。如果犯罪嫌疑人潜逃期间其违法所得被转移或隐匿，那么相关机关会依法进行追查和追缴。

具体建议：

• 对于剩余的1400万，首先需要明确其性质和来源。如果是合法财产，应依法保护；如果是犯罪所得或用于犯罪活动的财物，应依法追缴或没收。
• 密切关注法院的判决内容，了解法院对剩余款项的具体处理意见。如果判决中未明确提及，可以向法院或公安机关咨询相关处理进展。
• 如果认为自己的合法权益受到侵害，如合法财产被错误追缴或没收，可以依法提出申诉或申请复议，维护自己的合法权益。

法律依据：

• 《中华人民共和国刑法》第六十四条：犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或者责令退赔；对被害人的合法财产，应当及时返还；违禁品和供犯罪所用的本人财物，应当予以没收。没收的财物和罚金，一律上缴国库，不得挪用和自行处理。

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