结论：房屋买卖合同中双方自愿约定的赔偿总房款的双倍是否有效，需结合具体情况判断，若该约定不违反法律强制性规定、不违背公序良俗且双方意思表示真实，则可能有效；反之则可能无效或部分无效。以下从不同角度详细分析：

一、从合同效力的一般原则分析

根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同是民事主体之间设立、变更、终止民事法律关系的协议。依法成立的合同，受法律保护，对当事人具有法律约束力。合同的有效性通常取决于以下几个要素：

1. 双方意思表示真实：合同必须是双方真实意愿的体现，不存在欺诈、胁迫等情形。
2. 不违反法律强制性规定：合同内容不得违反法律、行政法规的强制性规定，否则将导致合同无效或部分无效。
3. 不违背公序良俗：合同内容不得违背社会公共利益和善良风俗。

在房屋买卖合同中，双方自愿约定的赔偿总房款的双倍，如果是在平等、自愿的基础上达成的，且不违反上述原则，那么该约定在法律上是可能被认可的。

二、从违约金约定的合理性分析

虽然双方可以自愿约定违约金，但违约金的数额应当合理。如果约定的违约金过分高于造成的损失，根据《民法典》的相关规定，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。

1. 违约金过高的认定：通常认为，如果违约金超过实际损失的30%，可能被视为过高。但这一标准并非绝对，具体还需根据案件情况综合判断。
2. 调整机制：如果一方认为违约金过高，可以向人民法院或仲裁机构提出调整请求。法院或仲裁机构会根据实际损失、合同履行情况、当事人过错程度等因素，综合判断是否调整违约金数额。

三、从房屋买卖合同的特殊性分析

房屋买卖合同涉及不动产的交易，具有其特殊性。在房屋买卖合同中，双方约定的赔偿条款可能受到更多法律限制和监管。

1. 房地产法规的适用：房屋买卖合同除了受《民法典》调整外，还可能受到《城市房地产管理法》等相关法规的约束。这些法规可能对房屋买卖合同的某些条款有特别规定。
2. 交易习惯与行业规范：在房屋买卖领域，存在一些交易习惯和行业规范。这些习惯和规范虽然不具有法律强制力，但可能对合同条款的合理性产生影响。

四、具体建议

1. 审查合同条款：在签订房屋买卖合同时，双方应仔细审查合同条款，确保约定的赔偿条款合法、合理。
2. 咨询专业意见：如果对合同条款有疑问或不确定其法律效力，建议咨询专业律师或法律机构，以获取更准确的法律意见。
3. 保留证据：在合同履行过程中，双方应保留好相关证据，如交易记录、沟通记录等，以备不时之需。

总结来说，房屋买卖合同中双方自愿约定的赔偿总房款的双倍是否有效，需结合具体情况判断。如果双方意思表示真实、不违反法律强制性规定和公序良俗，且违约金数额合理，则该约定可能有效。但无论如何，签订合同时都应谨慎审查条款，并在有疑问时咨询专业律师。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。