公司扣发绩效奖金是否合法，需视具体情况而定。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
合法的扣发情形
明确的规章制度与劳动合同约定
- 若公司依法制定了完善的绩效考核制度，并明确规定了绩效奖金的发放条件、考核标准以及扣减情形，且该制度已经过民主程序制定（如职工代表大会讨论、与工会或职工代表平等协商确定）并向员工公示，那么公司在员工未达到绩效标准时扣减绩效奖金是合法的。
- 同时，如果劳动合同中也明确约定了绩效工资标准及其扣除条件，公司依据这些约定进行扣减同样是合理合法的。例如，劳动合同中约定“员工若未完成年度销售目标，将扣除一定比例的绩效奖金”，且该目标设定合理，员工在未完成目标的情况下，公司扣减绩效奖金即属合法。
员工过错导致的经济损失
- 当员工因自身故意或重大过失给公司造成经济损失时，公司有权依据合法的规章制度或劳动合同中的约定，要求员工赔偿经济损失，并从其工资中扣除相应部分作为赔偿。但扣除的部分不得超过法律规定的限额，即每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。例如，员工因疏忽导致公司货物损坏，公司根据规章制度要求员工赔偿，并从其绩效奖金中扣除相应金额，此行为合法。
不合法的扣发情形
缺乏制度依据或未公示
- 如果公司没有关于绩效奖金考核及扣减的明确制度规定，或者虽有制度但未经民主程序制定、未向员工公示，那么公司随意扣减员工绩效奖金是不合法的。例如，公司突然以“表现不佳”为由扣减员工绩效奖金，但既无相关制度规定，也未提前告知员工，此行为即属违法。
不合理的考核标准
- 公司设定的绩效考核标准应当公平、公正、合理，并能真实反映员工的工作表现和贡献。如果考核标准明显不合理、不客观，甚至具有刁难员工的嫌疑，那么依据此标准进行的绩效奖金扣减是不合法的。例如，公司设定过高的销售目标，导致大部分员工无法完成，进而以此为由扣减绩效奖金，此行为即属违法。
随意改变考核规则
- 在绩效周期内，公司未经与员工协商一致，不得随意改变绩效考核规则。如果公司单方面改变规则并据此扣减绩效奖金，那么这种扣减行为是不合法的。例如，公司原本规定“员工完成季度目标即可获得全额绩效奖金”，但在季度末突然改变规则，要求员工完成更高的目标才能获得全额奖金，此行为即属违法。
无故扣减
- 根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，用人单位不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。因此，如果公司无故扣减员工的绩效奖金，那么这种行为是不合法的。例如，公司无任何理由地扣减员工绩效奖金，此行为即属违法。
员工维权途径
面对公司不合法的绩效奖金扣减行为，员工可以通过以下途径来维护自身权益：
与公司协商解决：首先尝试与公司进行沟通协商，了解扣减的具体原因和依据，并表达自己的意见和诉求。
向劳动行政部门投诉：如果协商无果，可以向当地劳动行政部门进行投诉，寻求政府部门的帮助和支持。
申请劳动仲裁或提起诉讼：如果以上途径均无法解决问题，员工可以向劳动仲裁机构申请仲裁或者向人民法院提起诉讼，通过法律途径来维护自身权益。
总结来说，公司扣发绩效奖金的合法性取决于多种因素的综合考量。员工在面临此类问题时，应了解自己的权益并依法维权；而公司也应确保规章制度的合法性、合理性和公平性，以避免不必要的法律纠纷。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。