公司可以部分项目选择清包工，但需满足一定条件并注意相关法律风险。以下从不同角度为你详细分析：

1. 法律层面：

   • 合法性：我国法律并未禁止公司对部分项目采用清包工的方式。清包工，即包工不包料，由承包人仅提供劳务，发包人提供施工所需的全部材料。只要公司与承包方签订的合同内容合法、双方意思表示真实，且不违反法律法规的强制性规定，该合同即具有法律效力。
   • 合同形式：为确保双方权益，建议采用书面形式签订清包工合同，明确约定工程范围、工期、质量标准、劳务报酬支付方式等关键条款。

2. 税务层面：

   • 税务处理：公司选择清包工方式时，需按照税法规定履行纳税义务。例如，若承包方为个人，公司可能需代扣代缴个人所得税；若承包方为企业，则需关注增值税、企业所得税等税种的缴纳问题。
   • 发票管理：为确保税务合规，公司应要求承包方提供合法有效的发票，以便进行成本抵扣和税务申报。

3. 管理层面：

   • 项目管理：清包工方式下，公司需自行负责材料的采购、供应和管理，这可能增加公司的管理成本和风险。因此，公司需建立完善的材料管理制度，确保材料质量、供应及时性和成本控制。
   • 质量控制：公司需加强对施工过程的质量监督，确保工程质量符合合同约定和行业标准。

4. 风险防控：

   • 合同风险：在签订清包工合同时，公司应仔细审查合同条款，避免模糊不清或存在歧义的表述，以减少合同纠纷的风险。
   • 劳务风险：公司需关注承包方劳务人员的资质和安全培训情况，确保施工过程中的安全。同时，公司可考虑为劳务人员购买工伤保险，以分散用工风险。

建议：公司在选择部分项目采用清包工方式时，应充分评估自身的管理能力、税务合规性和风险防控能力。如有需要，可咨询专业律师或税务顾问，以确保决策的合法性和合规性。如有任何法律疑问或需要进一步的法律支持，请随时向我咨询。