自然人独资的公司确实有股东，且股东仅为一个自然人。以下是对这一问题的详细分析：
一、自然人独资公司的定义与股东结构
自然人独资公司，也被称为一人有限责任公司，是指只有一个自然人股东或者一个法人股东的有限责任公司。在这种公司形式中，股东数量仅为一人，且该股东可以是自然人。因此，从定义上来看，自然人独资的公司确实存在股东，且这个股东就是投资设立该公司的自然人本身。
二、法律地位与责任承担
法律地位：自然人独资公司具有独立的法人地位，能够以自己的名义从事经营活动，并独立承担民事责任。这意味着，公司在法律上是一个独立的实体，与股东个人是分开的。
责任承担：股东对公司债务承担的是有限责任，即责任仅限于其认缴的出资额。然而，如果股东不能证明公司财产独立于个人财产，那么根据法律规定，股东需对公司债务承担连带责任。这一点体现了法律对一人有限责任公司股东责任的特殊规定，旨在保护公司债权人的利益。
三、自然人独资公司与个人独资企业的区别
在探讨自然人独资公司是否有股东时，还需要注意区分自然人独资公司与个人独资企业。虽然两者都表现为由一个自然人主导的经营实体，但在法律地位、责任承担及管理要求等方面存在显著差异：
法律地位：自然人独资公司具有独立的法人地位，而个人独资企业则不具备法人资格。
责任承担：自然人独资公司的股东承担有限责任（在特定情况下可能承担连带责任），而个人独资企业的投资人则以其个人财产对企业债务承担无限责任。
管理要求：自然人独资公司需按照《公司法》的相关规定进行规范管理，包括建立健全的公司治理结构和完善内部管理制度等；而个人独资企业在经营上则较为灵活，但缺乏像公司那样的治理结构和内部管理制度。
四、实际应用与注意事项
设立与变更：在设立自然人独资公司时，应明确股东身份及出资方式等关键事项，并按照相关法律法规进行规范操作。如果未来需要增加股东或变更公司形式（如从自然人独资公司变更为普通有限责任公司），则需按照法定程序进行修订公司章程、签署相关协议以及办理工商变更登记等手续。
风险防控：作为自然人独资公司的股东，应严格遵守法律法规和公司章程的规定，确保公司财产与个人财产的独立性和清晰性。同时，应建立健全的公司治理结构和内部管理制度，以降低滥用公司独立人格的风险并保护公司债权人的利益。
综上所述，自然人独资的公司确实有股东，且股东仅为一个自然人。在设立和运营自然人独资公司时，应充分了解其法律地位、责任承担及管理要求等方面的特点，并严格遵守相关法律法规和公司章程的规定。如果您在自然人独资公司的设立、运营或变更等方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。