是的，自然人独资企业确实只有一个股东，即投资设立该企业的自然人本人。以下是对这一问题的详细分析：
一、自然人独资企业的定义与股东结构
自然人独资企业，也被称为个人独资企业，是由一个自然人投资设立的企业形式。根据《中华人民共和国个人独资企业法》第二条的规定，个人独资企业是指依照本法在中国境内设立，由一个自然人投资，财产为投资人个人所有，投资人以其个人财产对企业债务承担无限责任的经营实体。从这一定义中可以看出，自然人独资企业的股东结构非常简单，仅有一个股东，即投资设立该企业的自然人。
二、自然人独资企业的法律地位与责任承担
法律地位：自然人独资企业不具有独立的法人资格，其财产与投资人的个人财产紧密相连，没有明确的界限。这意味着，企业的经营状况直接影响到投资人的个人财产安全。
责任承担：由于自然人独资企业不具有法人资格，投资人需要以其个人财产对企业债务承担无限责任。如果企业无法清偿债务，投资人的个人财产可能会被用于偿债。这种责任承担方式与有限责任公司或股份有限公司等具有法人资格的企业形式存在显著差异。
三、自然人独资企业与一人有限责任公司的区别
虽然自然人独资企业和一人有限责任公司都表现为由一个自然人或法人主导的经营实体，但它们在法律地位、责任承担及管理要求等方面存在显著差异。
法律地位：一人有限责任公司具有独立的法人地位，能够以自己的名义从事经营活动，并独立承担民事责任。而自然人独资企业则不具有法人资格。
责任承担：一人有限责任公司的股东对公司债务承担的是有限责任，即责任仅限于其认缴的出资额。而自然人独资企业的投资人则需要以其个人财产对企业债务承担无限责任。
管理要求：一人有限责任公司仍需按照《公司法》的相关规定进行规范管理，包括建立健全的公司治理结构和完善内部管理制度等。而自然人独资企业在经营上则相对灵活，但缺乏像公司那样的治理结构和内部管理制度。
四、实际应用建议
选择适合的企业类型：在设立企业时，出资人应根据自身实际情况和需求选择适合的企业类型。如果希望获得独立法人地位和有限责任保护，可以选择设立一人有限责任公司；如果经营规模较小、经营灵活且愿意承担无限责任，则可以选择设立自然人独资企业。
遵守相关法律法规：无论选择哪种企业类型，出资人都应严格遵守相关法律法规的规定，确保企业的合法经营和投资人的合法权益。
寻求专业法律咨询：在设立和运营企业过程中，如果遇到任何法律问题或困惑，建议及时向我咨询，以便获得专业、准确的法律建议和指导。
综上所述，自然人独资企业确实只有一个股东，即投资设立该企业的自然人本人。在选择企业类型时，出资人应根据自身实际情况和需求进行谨慎考虑，并严格遵守相关法律法规的规定。如有任何法律问题或困惑，请随时向我咨询。