结论：棚子修缮过程中扣留吊车是否会被处罚，取决于扣留行为的合法性及具体情节。若扣留行为缺乏法律依据或超出必要限度，可能面临民事赔偿、行政处罚甚至刑事责任。以下从不同角度详细分析：

一、扣留行为的合法性分析

1. 合法扣留的情形
   若吊车在修缮过程中因施工方过错（如操作不当导致棚子损坏）被扣留，且扣留目的是为了保全证据或等待赔偿协商，需满足以下条件才可能被认定为合法：

   • 扣留行为有明确法律依据（如《民法典》中关于留置权的规定，但需注意留置权通常适用于债务履行场景，此处需谨慎适用）；
     
   • 扣留方式合理，未超出必要限度（如未损坏吊车、未长时间扣留导致车主损失扩大）；
     
   • 及时通过法律途径解决纠纷（如协商、诉讼或仲裁），而非长期扣留。

2. 非法扣留的情形
   若扣留行为缺乏法律依据，或存在以下情形，则可能被认定为非法：

   • 扣留目的与纠纷无关（如因私人恩怨扣留）；
     
   • 扣留方式粗暴（如损坏吊车、限制车主人身自由）；
     
   • 长时间扣留且未通过法律途径解决，导致车主损失扩大。

二、可能面临的法律后果

1. 民事赔偿
   若扣留行为导致吊车车主损失（如停运损失、车辆损坏修复费用等），车主有权要求扣留方赔偿。赔偿范围以实际损失为限，需车主提供证据证明损失与扣留行为的因果关系。

2. 行政处罚
   若扣留行为违反《治安管理处罚法》相关规定（如非法限制他人人身自由、故意损毁财物等），公安机关可对扣留方处以警告、罚款或行政拘留。例如：

   • 非法限制车主人身自由：可处5-10日拘留，并处200-500元罚款；
     
   • 故意损毁吊车：可处5-10日拘留，并处200-500元罚款；情节较重的，处10-15日拘留，可并处1000元以下罚款。

3. 刑事责任
   若扣留行为情节严重（如扣留过程中使用暴力、扣留时间过长导致车主重大损失等），可能构成犯罪。例如：

   • 非法拘禁罪：若扣留过程中限制车主人身自由，且达到刑事立案标准（如拘禁时间超过24小时），可能被追究刑事责任；
     
   • 故意毁坏财物罪：若扣留过程中故意损坏吊车，且损失金额达到刑事立案标准（如5000元以上），可能被追究刑事责任。

三、建议与风险提示

1. 优先通过法律途径解决纠纷
   若因棚子修缮与吊车方产生纠纷，建议通过协商、诉讼或仲裁等合法方式解决，避免自行扣留车辆导致法律风险升级。

2. 扣留前评估合法性
   若确需扣留车辆，需提前评估扣留行为的合法性及可能后果，确保扣留目的正当、方式合理，并尽快通过法律途径固定证据、解决纠纷。

3. 保留证据
   无论是否扣留车辆，均需保留与纠纷相关的证据（如合同、照片、视频、沟通记录等），以便在后续法律程序中维护自身权益。

总结：棚子修缮过程中扣留吊车是否会被处罚，需结合扣留行为的合法性及具体情节判断。建议优先通过法律途径解决纠纷，避免自行扣留导致法律风险。如有进一步疑问或需要法律帮助，可直接向我咨询。