结论：医院承担次要责任对五级伤残的赔偿影响较大，具体影响程度需结合事故责任划分、赔偿项目及计算方式综合判断。以下从不同角度详细分析：

一、责任划分对赔偿总额的影响

根据《工伤保险条例》及《民法典》侵权责任编，工伤赔偿与医疗损害赔偿可能存在竞合。若医院存在过错（如误诊、治疗不当等）导致伤残加重，需根据过错程度承担相应比例的赔偿责任。例如：

1. 假设总赔偿为100万元：

   • 若医院承担20%次要责任，则需额外赔偿20万元；
   • 若医院承担30%责任，则需赔偿30万元。 计算公式：医院赔偿额 = 总赔偿额 × 医院责任比例

2. 责任比例的认定：

   • 需通过医疗事故鉴定或司法鉴定明确医院过错与伤残结果的因果关系；
   • 实践中，次要责任比例通常为10%-40%，具体由法院或调解机构根据案情裁定。

二、赔偿项目的差异

五级伤残的赔偿项目包括：

1. 工伤保险赔偿（无过错责任）：

   • 一次性伤残补助金：18个月本人工资；
   • 伤残津贴：本人工资的70%（按月支付至退休）；
   • 医疗费、护理费、辅助器具费等。

2. 医院侵权赔偿（过错责任）：

   • 医疗费差额：若医院过错导致额外医疗支出；
   • 残疾赔偿金：按人身损害赔偿标准计算（与工伤标准可能不同）；
   • 精神损害抚慰金：根据伤残等级和过错程度酌定（五级伤残通常为5万-10万元）。

关键点：若医院过错导致伤残等级提高（如从六级升至五级），其赔偿比例会显著增加。

三、实务中的处理方式

1. 双赔原则：

   • 工伤赔偿与医疗损害赔偿可并行主张，但医疗费、护理费等实际支出项目可能无法重复获赔；
   • 残疾赔偿金与一次性伤残补助金性质不同，通常可同时主张。

2. 诉讼策略建议：

   • 优先申请工伤认定并享受工伤保险待遇；
   • 同步启动医疗事故鉴定，明确医院责任比例；
   • 通过调解或诉讼主张医院侵权赔偿，最大化受害人权益。

四、风险提示

1. 证据固定：

   • 需保留全部医疗记录、鉴定报告、费用单据等证据；
   • 医院过错需通过专业鉴定证明，否则可能承担举证不能后果。

2. 时效限制：

   • 工伤认定申请需在事故发生后1年内提出；
   • 医疗损害赔偿诉讼时效为3年，自知道或应当知道损害之日起计算。

建议：立即委托律师介入，同步推进工伤认定和医疗事故鉴定，根据责任比例和赔偿标准制定索赔方案。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作流程。