当检察院两次不批捕后，这通常意味着检察机关经过审查认为犯罪嫌疑人不符合逮捕条件，或者案件目前的证据不足、事实不够清晰。面对这种情况，公安机关需要依据法律规定，采取一系列相应的措施来处理，同时确保犯罪嫌疑人的合法权益得到充分保障。
公安机关的处理措施
立即释放或变更强制措施：
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，一旦检察院不批准逮捕，公安机关应当在接到通知后立即释放被拘留的犯罪嫌疑人。如果犯罪嫌疑人之前已被羁押，此时应撤销羁押状态。
- 若公安机关认为仍有必要对犯罪嫌疑人进行一定程度的控制，以确保诉讼程序的顺利进行，可以依法变更强制措施，例如将拘留变更为取保候审或监视居住。
继续侦查与补充证据：
- 检察院的不批捕决定并不等同于案件侦查的终结。公安机关应根据案件的具体情况，继续展开侦查工作，努力收集、调取能够证明犯罪嫌疑人有罪或无罪、罪轻或罪重的证据材料。
- 如果在后续的侦查过程中发现了新的证据，且这些证据足以证明犯罪嫌疑人符合逮捕条件，公安机关可以重新提请检察院批准逮捕。
撤销案件：
- 若经过深入的侦查后，公安机关发现案件中并没有犯罪事实，或者犯罪嫌疑人的犯罪情节显著轻微，不需要追究刑事责任，那么公安机关应当依法撤销案件，并及时通知检察院。
人民检察院的监督职责
- 检察院在作出不批捕决定后，并非就此放手不管。它还需要监督公安机关是否按照法律规定立即释放了被拘留人，以及是否按规定变更了强制措施等。
- 如果公安机关在后续侦查中重新提请了逮捕，检察院还需要对新的证据和案件情况进行全面的审查，以判断是否符合逮捕条件，并据此作出是否批准逮捕的决定。
犯罪嫌疑人的权益保障
- 在整个处理过程中，犯罪嫌疑人的合法权益必须得到充分的保障。犯罪嫌疑人及其法定代理人、近亲属或辩护人有权在检察院两次不批捕后，要求解除已采取的强制措施。
- 如果犯罪嫌疑人认为自己被错误拘留，且符合《中华人民共和国国家赔偿法》规定的条件，他还有权依法申请国家赔偿。
总结与建议
检察院两次不批捕是一个重要的法律节点，它要求公安机关、人民检察院以及犯罪嫌疑人各方都要依法行事，确保案件的公正处理。对于公安机关而言，应继续侦查、补充证据，并在必要时变更强制措施或撤销案件；对于人民检察院而言，应履行好监督职责，确保公安机关的处理合法合规；对于犯罪嫌疑人而言，应了解自己的权利和义务，必要时可咨询资深刑事辩护律师以获取更专业的法律建议。通过合法、公正的程序处理案件，既能维护社会正义，也能充分保障个人的合法权益。