农民工工资专户是否需要三方协议，需分情况讨论：

1. 法律明确要求签订三方协议的情形
   根据《保障农民工工资支付条例》第三十一条规定，分包单位委托施工总承包单位代发农民工工资时，必须签订三方协议。协议主体为：

   • 施工总承包单位（开设工资专户的主体）
     
   • 分包单位（实际用工单位）
     
   • 农民工本人（工资接收方）
     协议需明确工资支付标准、支付时间、代发方式等核心条款，确保工资直接发放至农民工个人账户，避免分包单位截留、挪用。

2. 非代发情形下的协议要求
   若施工总承包单位直接与农民工签订劳动合同并自行发放工资（即不存在分包单位代发情形），则无需签订三方协议。但需注意：

   • 施工总承包单位仍需按《条例》要求开设农民工工资专用账户，并由银行代发工资；
     
   • 需保留工资发放记录、考勤表等证据，以备劳动监察部门核查。

3. 实务建议

   • 协议必要性：即使法律未强制要求三方协议（如总包直接用工），也建议签订书面协议，明确各方权利义务，降低纠纷风险；
     
   • 协议内容：若涉及代发，协议需包含工资计算方式、支付周期、违约责任等条款，并由三方签字盖章；
     
   • 账户管理：工资专户需独立于工程款账户，专款专用，禁止挪作他用，否则可能面临行政处罚。

总结：若存在分包单位委托代发工资的情形，必须签订三方协议；若总包直接用工，则无需三方协议，但需遵守工资专户管理规定。如有具体操作疑问，可进一步向我咨询。