涂改的宅基地证无效，一般由土地管理部门或司法鉴定机构进行鉴定。以下是对此问题的详细分析：

1. 土地管理部门鉴定：

   • 法律依据：根据《土地管理法》及相关规定，土地管理部门是负责土地登记、发证及管理的权威机构。对于宅基地证的合法性、真实性及有效性，土地管理部门具有专业的审查能力和职责。
   • 鉴定流程：当发现宅基地证存在涂改等疑似无效情形时，当事人可以向当地土地管理部门提出申请，要求其对宅基地证的真实性、合法性进行鉴定。土地管理部门将依据相关法律法规和程序，对宅基地证进行审查，并出具鉴定意见。

2. 司法鉴定机构鉴定：

   • 法律依据：在涉及宅基地证无效的纠纷中，如果当事人对土地管理部门的鉴定意见存在异议，或者纠纷已经进入诉讼程序，那么司法鉴定机构将作为独立的第三方，对宅基地证进行鉴定。
   • 鉴定流程：司法鉴定机构将依据相关法律法规和鉴定标准，对宅基地证进行技术鉴定，包括但不限于笔迹鉴定、印章鉴定等，以确定宅基地证是否存在涂改等无效情形。鉴定结果将作为法院裁判的重要依据。

法律建议：

• 如果您发现宅基地证存在涂改等疑似无效情形，建议首先向当地土地管理部门提出申请，要求其对宅基地证进行鉴定。
• 如果对土地管理部门的鉴定意见存在异议，或者纠纷已经进入诉讼程序，您可以考虑委托司法鉴定机构对宅基地证进行鉴定。
• 在处理宅基地证无效纠纷时，务必保留好相关证据，如宅基地证原件、涂改痕迹的照片或视频等，以便在鉴定或诉讼过程中提供有力支持。

可能法律后果：

• 如果宅基地证被鉴定为无效，那么该宅基地证将不再具有法律效力，相关权益将受到影响。
• 在宅基地证无效纠纷中，如果当事人存在伪造、变造宅基地证等违法行为，将可能面临法律责任，包括但不限于行政处罚、刑事责任等。

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