针对您提出的“父亲去世后如何查欠多个银行的债务，以及这些债务是否会从抚慰金中扣除”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、如何查询父亲在多个银行的债务情况
利用便民服务查询银行卡线索：
- 如果您身处河南省，可以利用当地推出的“已故人员银行卡账户线索查询”服务。这项服务由人民银行河南省分行指导中国银联河南分公司推出，旨在解决群众在遗产继承时遭遇的“查卡难”痛点。
- 您只需前往任一试点银行网点（目前河南省共4家银行25家试点网点可受理查询，覆盖郑州市8个主城区及17个地级市），提交已故人员和查询人的姓名、身份证号等身份信息及相关证明材料，即可查询到已故亲属在30余家银行的开卡线索。
- 需要注意的是，该服务仅反馈已故人员开户银行名称，不涉及银行卡号、账户余额等敏感信息。您可根据查询结果，后续按现有法律规定到相关银行办理存款查询和提取业务，同时也可以咨询银行关于债务的情况。
传统方式查询：
- 如果您不在河南省或无法利用上述便民服务，您可能需要采取传统方式，即逐一前往各银行机构核实父亲的债务情况。这可能需要您准备充分的证明材料，如父亲的死亡证明、您的身份证明以及与父亲的关系证明等。
二、债务是否会从抚慰金中扣除
债务与抚慰金的性质：
- 债务是父亲生前所欠的金钱或其他财产性义务，而抚慰金（通常指死亡赔偿金或抚恤金）是父亲去世后，由相关机构或个人给予家属的经济补偿或精神抚慰。
- 这两者在法律上是独立的，债务不会因父亲的去世而自动消失，但也不会直接从抚慰金中扣除。
债务的清偿顺序：
- 在父亲去世后，其遗产（包括银行存款、房产等）应首先用于清偿其生前所欠的债务。
- 如果遗产不足以清偿全部债务，那么债权人可能需要按照法律规定的顺序和比例受偿。
- 抚慰金通常不属于遗产范畴，因此不会直接用于清偿债务。但是，如果家属在领取抚慰金后，自愿用部分或全部抚慰金来清偿父亲的债务，这是法律允许的。
实际操作建议：
- 在处理父亲的遗产和债务时，建议您咨询专业的法律人士或律师，以确保您的权益得到妥善保护。
- 如果您担心债务问题会影响到您和家人的生活，可以考虑与债权人协商制定还款计划或寻求其他解决方案。
综上所述，查询父亲在多个银行的债务情况可以通过利用便民服务或传统方式实现；而债务通常不会直接从抚慰金中扣除，但遗产应首先用于清偿债务。希望这些解答能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。