两家供应商分支机构负责人为同一人，是否会被认定为关联关系，需结合具体情况及关联关系的认定标准来综合判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
一、关联关系的法律定义与认定标准
根据《公司法》及相关税收、会计法规，关联关系通常指的是企业与其他企业、个人之间存在直接或间接控制关系、重大影响关系，或者同为第三方所控制、重大影响等情形。具体来说，可能包括：
- 股权控制关系：如一方直接或间接持有另一方的股份达到一定比例（如25%以上），或者双方同为某一第三方所持有股份达到一定比例。
- 经营管理控制关系：如一方在经营、资金、购销等方面对另一方存在直接或间接的控制关系。
- 亲属关系或特定身份关系：如企业的董事、监事、高级管理人员与其直接或者间接控制的企业之间的关系，以及存在其他可能影响企业独立经营决策的关系。
二、分支机构负责人为同一人的情况分析
若分支机构独立核算且无其他关联因素：
- 仅凭分支机构负责人为同一人，并不足以直接认定两家供应商之间存在关联关系。因为分支机构通常作为总公司的延伸，其负责人可能同时管理多个分支机构，但这并不构成对分支机构之间或分支机构与总公司之间控制关系的直接证据。
- 除非能证明该负责人通过其职位对两家供应商的经营决策、资金流动、购销渠道等产生了实质性影响，且这种影响达到了关联关系的认定标准。
若存在其他关联因素：
- 如果两家供应商之间除了分支机构负责人为同一人外，还存在股权控制、经营管理控制、亲属关系或特定身份关系等其他关联因素，那么很可能被认定为存在关联关系。
- 例如，如果两家供应商同为某一集团公司的子公司，或者它们的实际控制人相同，那么即使分支机构负责人为同一人只是表面现象，但背后的股权或控制关系才是认定关联的关键。
三、实际案例与司法实践
- 在司法实践中，法院或税务机关在认定关联关系时，会综合考虑多种因素，包括但不限于股权结构、经营管理关系、资金流动、购销渠道等。
- 仅凭分支机构负责人为同一人这一单一因素，通常不足以构成认定关联关系的充分条件。但如果有其他证据表明该负责人对两家供应商的经营决策产生了实质性影响，那么可能被视为关联关系的间接证据。
四、建议与风险提示
对于供应商而言：
- 如果两家供应商之间确实存在关联关系，应主动披露并遵守相关法律法规的规定，如进行关联交易申报、避免不公平的关联交易等。
- 如果仅因分支机构负责人为同一人而被误认为存在关联关系，应及时提供证据证明双方之间的独立性，以避免不必要的法律风险和税务负担。
对于采购方而言：
- 在与供应商合作时，应关注供应商之间的关联关系，以评估合作风险。
- 如果发现供应商之间存在关联关系，应要求供应商提供详细的关联交易信息，并评估这些交易是否公平、合理，以避免因关联交易而损害自身利益。
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