自己拥有工厂并同时经营出口贸易公司，这一行为本身并不违法。不过，这一结论的成立需要满足一些前提条件，并且在实际操作中需要注意一些法律要点，下面我将从多个角度为你详细分析：

一、前提条件

1. 合法注册与经营：

   • 工厂和出口贸易公司都需要按照相关法律法规进行合法注册，取得相应的营业执照和经营许可。
   • 确保公司的经营范围、注册资本、股东结构等符合法律要求。

2. 遵守外贸法规：

   • 出口贸易公司需要遵守国家关于外贸的法律法规，包括但不限于进出口管理、关税缴纳、外汇管理等方面的规定。
   • 确保出口的商品符合国家的质量标准和安全要求，避免出口违禁品或侵犯知识产权的商品。

3. 税务合规：

   • 工厂和出口贸易公司都需要按照税法规定进行税务登记和纳税申报，确保税务合规。
   • 避免偷税漏税等违法行为，以免面临法律处罚。

二、实际操作中的法律要点

1. 关联交易与公平交易：

   • 如果工厂和出口贸易公司之间存在关联交易（如工厂向出口贸易公司供应原材料或产品），需要确保交易价格的公平性和合理性，避免通过关联交易进行避税或转移利润等违法行为。
   • 关联交易应当符合市场原则，有合理的商业目的和正当的商业理由。

2. 合同与单据管理：

   • 出口贸易公司需要与客户签订详细的出口合同，明确双方的权利和义务。
   • 妥善保管出口合同、发票、装箱单、提单等单据，以备海关查验和税务审计。

3. 知识产权保护：

   • 确保出口的商品不侵犯他人的知识产权，如专利、商标、著作权等。
   • 如果出口的商品涉及知识产权，需要取得相应的授权或许可。

三、可能面临的法律风险及后果

1. 行政处罚：

   • 如果违反外贸法规或税务法规，可能面临海关、税务等行政部门的处罚，如罚款、没收违法所得、吊销营业执照等。

2. 刑事责任：

   • 在严重情况下，如涉及走私、偷税漏税等违法行为，可能构成犯罪，需要承担刑事责任。

四、建议与措施

1. 加强法律学习：

   • 作为工厂和出口贸易公司的经营者，应当加强对外贸法规、税法等相关法律的学习，确保合法经营。

2. 建立合规体系：

   • 建立完善的合规体系，包括内部管理制度、风险控制机制等，确保公司的经营活动符合法律要求。

3. 寻求专业帮助：

   • 在涉及复杂法律问题时，可以寻求专业律师或法律顾问的帮助，确保公司的合法权益得到保障。

总结来说，自己拥有工厂并同时经营出口贸易公司并不违法，但需要满足合法注册与经营、遵守外贸法规、税务合规等前提条件，并在实际操作中注意关联交易与公平交易、合同与单据管理、知识产权保护等法律要点。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。