确认合同无效的案件，其管辖法院的确定主要依据合同纠纷的一般管辖原则，但也有一些特殊情况需要注意。以下是我从不同角度为你详细分析：
一、一般原则：被告住所地或合同履行地法院管辖
被告住所地：根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，对公民提起的民事诉讼，由被告住所地人民法院管辖；被告住所地与经常居住地不一致的，由经常居住地人民法院管辖。对法人或者其他组织提起的民事诉讼，由被告住所地人民法院管辖。因此，在确认合同无效的案件中，如果被告是公民，通常由被告住所地法院管辖；如果被告是法人或其他组织，则由被告住所地（即注册地或主要办事机构所在地）法院管辖。
合同履行地：合同纠纷案件也可以由合同履行地人民法院管辖。合同履行地是指合同约定的履行义务的地点，或者实际履行义务的地点。在确认合同无效的案件中，如果合同中有明确的履行地约定，且该约定不违反法律规定，那么合同履行地法院也有管辖权。
二、特殊情况：专属管辖与协议管辖
专属管辖：某些特定类型的合同纠纷案件，如因不动产纠纷提起的诉讼，由不动产所在地人民法院专属管辖。在确认这类合同无效的案件中，即使合同中有其他管辖约定，也应当由不动产所在地法院管辖。
协议管辖：合同双方当事人可以在书面合同中协议选择被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地等与争议有实际联系的地点的人民法院管辖，但不得违反级别管辖和专属管辖的规定。如果合同中有有效的管辖协议，那么确认合同无效的案件应当由协议约定的法院管辖。但需要注意的是，如果合同本身无效，那么其中的管辖协议也可能被认定为无效，此时应当回归到一般原则来确定管辖法院。
三、实际操作中的建议
审查合同条款：在提起确认合同无效的诉讼前，应当仔细审查合同中的管辖条款，确定是否存在有效的管辖协议。
确定被告住所地和合同履行地：如果合同中没有有效的管辖协议，那么应当确定被告住所地和合同履行地，以便选择正确的管辖法院。
考虑诉讼成本和效率：在选择管辖法院时，除了考虑法律规定外，还应当考虑诉讼成本和效率。例如，选择距离自己较近的法院可能更有利于节省诉讼成本和提高诉讼效率。
举例说明：假设甲和乙签订了一份买卖合同，约定由甲向乙出售一批货物，并约定了合同履行地为甲所在地。后来，甲认为合同无效并提起诉讼。在这个案例中，如果合同中没有有效的管辖协议，那么甲可以选择向乙住所地法院或甲所在地（即合同履行地）法院提起诉讼。
总结来说，确认合同无效的案件管辖法院的确定主要依据合同纠纷的一般管辖原则，即被告住所地或合同履行地法院管辖。同时，也需要注意专属管辖和协议管辖的特殊情况。在实际操作中，应当仔细审查合同条款、确定被告住所地和合同履行地，并考虑诉讼成本和效率等因素来选择正确的管辖法院。如果你在此过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。