在司法实践中，一个案件涉及多个犯罪嫌疑人、多个罪名时，通常采取“分别处理、合并审理”的原则，具体处理方式需结合案件事实、证据情况及法律适用综合判断。以下是具体分析：

1. 程序上的处理：分案或并案

• 并案处理：若多个犯罪嫌疑人、多个罪名之间存在关联性（如共同犯罪、牵连犯罪、连续犯罪等），司法机关通常会合并审理，以提高诉讼效率、避免矛盾裁判。例如：
  • 共同犯罪中，主犯与从犯的罪名相同（如共同诈骗），但分工不同；
  • 牵连犯罪中，犯罪手段与目的涉及不同罪名（如伪造公文后实施诈骗）。
• 分案处理：若犯罪嫌疑人之间无关联性，或罪名差异较大（如一人涉嫌故意杀人，另一人涉嫌盗窃），司法机关可能分别立案、分别审理，以保障各被告人的诉讼权利。

2. 实体上的处理：罪名认定与量刑

• 罪名独立认定：每个犯罪嫌疑人的行为需单独评价，符合哪个罪名的构成要件，就认定哪个罪名。例如：
  • 甲、乙共同抢劫，但甲在抢劫后单独实施强奸，则甲涉嫌抢劫罪和强奸罪，乙仅涉嫌抢劫罪；
  • 丙、丁合谋盗窃，但丁在盗窃过程中使用暴力抗拒抓捕，则丙涉嫌盗窃罪，丁涉嫌抢劫罪（转化型抢劫）。
• 数罪并罚：若一个犯罪嫌疑人实施多个独立犯罪行为，分别构成不同罪名，则数罪并罚。例如：
  • 戊因琐事殴打他人致轻伤（故意伤害罪），后又伪造证据（帮助毁灭、伪造证据罪），则需对两罪并罚。

3. 特殊情形：共同犯罪中的罪名差异

• 部分实行全部责任：在共同犯罪中，即使部分犯罪嫌疑人仅参与部分行为，也可能对全部犯罪结果承担责任。例如：
  • 己、庚共同盗窃，己负责望风，庚入室行窃，但庚在行窃时临时起意强奸被害人，则己仅对盗窃罪负责，庚需对盗窃罪和强奸罪并罚。
• 实行过限：若共同犯罪中，某一犯罪嫌疑人超出共同故意实施其他犯罪，其他犯罪嫌疑人不承担该部分责任。例如：
  • 辛、壬合谋诈骗，但辛在诈骗后单独实施非法拘禁，则壬仅对诈骗罪负责，辛需对诈骗罪和非法拘禁罪并罚。

4. 实务建议

• 对犯罪嫌疑人：若涉及多个罪名，需全面梳理行为性质，区分共同犯罪与个人犯罪，避免因证据不足或法律理解偏差导致罪名认定错误。
• 对被害人：若案件涉及多个犯罪嫌疑人，需及时固定证据（如监控、证人证言），明确各嫌疑人的行为与损害结果的因果关系，以维护自身权益。

总结：一个案件涉及多个犯罪嫌疑人、多个罪名时，司法机关会结合案件关联性决定并案或分案处理，实体上对每个嫌疑人的行为独立评价罪名，数罪并罚或部分实行全部责任。具体案件需结合证据和法律适用综合判断，如有疑问可直接向我咨询。