关于二十年前购买的别村房子能否确权及合法性的问题，结论需分情况讨论：

1. 若购房时符合当时法律法规及政策要求：

   • 合法性确认：如果二十年前购买别村房子时，已经按照当时的法律法规和政策要求办理了相关手续，如签订了合法的买卖合同、支付了合理的价款，并且已经实际占有和使用该房屋多年，同时没有违反当时的土地管理、房屋买卖等相关规定，那么该购房行为在法律上是有效的，房屋可以依法进行确权。
   • 确权流程：确权通常需要向当地的房地产管理部门或相关机构提交申请，并提供购房合同、付款凭证、身份证明等相关材料。经过审核后，如果符合确权条件，相关部门会颁发房屋产权证书，确认房屋的所有权归属。

2. 若购房时存在违法违规情形：

   • 违法性分析：如果购房时违反了当时的法律法规或政策要求，如未经批准擅自购买别村土地上的房屋、未签订合法合同或合同内容违法、未支付合理价款等，那么该购房行为可能被视为违法或无效。
   • 法律后果：在这种情况下，房屋可能无法进行确权，甚至可能面临被收回、罚款等法律后果。此外，如果购房行为涉及欺诈、胁迫等非法手段，还可能承担刑事责任。

3. 特殊情况考虑：

   • 农村房屋买卖限制：根据现行法律法规，农村房屋的买卖通常受到一定限制，特别是非本村集体经济组织成员购买别村房屋可能面临法律障碍。然而，如果购房行为发生在二十年前，且当时法律法规对此没有明确限制或限制较为宽松，那么可能需要根据具体情况进行判断。
   • 历史遗留问题处理：对于一些历史遗留的房屋买卖问题，政府可能会出台相关政策进行妥善处理。因此，在处理此类问题时，建议咨询当地房地产管理部门或相关机构，了解具体政策要求。

法律建议：

• 收集证据：首先，您需要收集与购房行为相关的所有证据，包括购房合同、付款凭证、身份证明、房屋使用证明等。这些证据将有助于证明您的购房行为的合法性和有效性。
• 咨询专业机构：其次，建议您咨询当地的房地产管理部门或相关机构，了解确权的具体流程和要求。他们可以根据您的具体情况提供针对性的指导和建议。
• 寻求法律帮助：如果您在确权过程中遇到法律难题或争议，可以寻求专业律师的帮助。律师可以根据您的具体情况提供法律意见和解决方案，帮助您维护自己的合法权益。

可能面临的法律后果：

• 如果购房行为合法且符合确权条件，您将获得房屋产权证书，确认房屋的所有权归属。
• 如果购房行为存在违法违规情形，您可能面临房屋无法确权、被收回、罚款等法律后果。在极端情况下，如果购房行为涉及刑事犯罪，您还可能承担刑事责任。

总结与提醒：二十年前购买的别村房子能否确权及合法性取决于购房时的法律法规和政策要求以及购房行为的具体情况。在处理此类问题时，建议您收集相关证据、咨询专业机构并寻求法律帮助，以确保自己的合法权益得到维护。如果您有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。