在行政诉讼中，如果遇到了诉错被告主体且案件已经开庭审理完毕的情况，我们需要根据《中华人民共和国行政诉讼法》及其相关司法解释来妥善处理。以下是对此问题的详细解答：
一、处理原则
在行政诉讼中，被告主体的准确性至关重要。如果被告主体错误，法院会根据诉讼阶段的不同，采取相应措施来确保诉讼的准确性和公正性。这包括告知原告变更被告、裁定驳回起诉或依职权追加、变更被告等。
二、具体处理方式
若法院在审理过程中已发现被告主体错误：
- 法院建议变更被告：根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国行政诉讼法〉的解释》，如果原告所起诉的被告不适格，法院应当告知原告变更被告。如果原告同意变更，法院将继续审理；如果原告不同意变更，法院将裁定驳回起诉。
- 法院依职权追加或变更被告：在涉及多个行政机关共同作出行政行为的案件中，如果原告只起诉了部分机关，而法院经审查认为其他机关也应作为共同被告，法院可以依职权追加这些机关为被告。
若案件已开庭审理完毕且发现被告主体错误：
- 上诉阶段处理：如果一审存在被告主体错误且影响案件正确审理，当事人可以在上诉时提出。二审法院经审查确认错误后，可能会裁定撤销原判，发回重审。这是因为一审法院未正确认定适格被告，可能导致事实认定不清或法律适用错误。
- 再审阶段处理：在再审程序中，如果发现原生效裁判存在被告主体错误，且该错误对当事人实体权利产生实质性影响，再审法院将撤销原生效裁判，重新审理并作出正确裁判。
三、注意事项
变更被告的时机与限制：
- 原告应在起诉前仔细核对被告信息，确保被告主体适格。在诉讼过程中，通常不允许变更被告以更正错误主体，因为这可能意味着承担责任主体的彻底变化。
避免重复起诉：
- 如果被告被裁定驳回起诉后，原告又变更被告针对同一行政行为提起行政诉讼，这通常会被认定为重复起诉，法院可能不予受理。
证据的收集与提交：
- 原告应提供充分证据证明被告主体不适格或存在需要变更被告的情形。这有助于确保诉讼的顺利进行，并增加法院采纳原告主张的可能性。
四、法律依据
- 《中华人民共和国行政诉讼法》第二十六条：明确了行政诉讼被告的一般规则，即作出行政行为的行政机关是被告。
- 《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国行政诉讼法〉的解释》第二十六条：直接规定了被告主体不当时的处理方式，即法院应当告知原告变更被告；原告不同意变更的，裁定驳回起诉。
综上所述，如果行政诉讼中诉错了被告主体且案件已经开庭审理完毕，当事人应根据具体情况选择上诉或申请再审，并积极配合法院工作，提供充分证据以支持自己的主张。同时，原告也应在起诉前仔细核对被告信息，以避免此类问题的发生。