公司和仓库不在一起，在一般情况下是合法的。以下从不同角度为你详细分析：

法律层面

从现行法律法规来看，并没有明确规定公司的经营场所和仓库必须位于同一地址。公司的注册地址主要是用于确定公司的法律管辖地、税务登记地以及作为公司对外公示的法定地址等。而仓库则是公司用于存储货物、物资等实际经营活动的场所，其位置的选择更多地取决于公司的实际经营需求、物流成本、仓储条件等多种因素。只要公司的注册地址和仓库地址都符合相关法律法规的要求，比如都经过了合法的登记或备案（如果需要的话），并且没有违反其他特定的法律规定（如某些特殊行业对仓库位置有特殊要求的），那么公司和仓库不在一起就是合法的。

实际经营层面

在实际经营中，很多公司出于成本考虑、业务布局需要或者物流便利性等因素，会选择将公司和仓库分开设置。例如，一些电商公司可能将总部和客服中心设置在城市中心区域，以便更好地接触客户和进行市场推广；而将仓库设置在城市郊区或者物流园区，以降低仓储成本和方便货物的进出。这种做法在商业实践中是非常普遍的，也是被法律所允许的。

注意事项

虽然公司和仓库不在一起是合法的，但公司在实际经营中还是需要注意以下几点：

1. 确保仓库的合法性：如果仓库需要办理相关的许可证或者进行备案登记，公司应当及时办理，以确保仓库的合法使用。
2. 完善内部管理：公司和仓库分开后，可能会增加一些管理上的难度，比如货物的运输、库存的管理等。因此，公司需要完善内部管理制度，确保货物的安全和库存的准确。
3. 遵守税务和财务规定：公司和仓库分开后，可能会涉及到不同地区的税务和财务问题。公司需要遵守相关的税务和财务规定，确保税务申报的准确性和财务记录的完整性。

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