结论：甲方签无固定期限合同只敲章，合同是否有效需分情况讨论，一般来说，若符合法定形式要件且内容合法，合同有效；但若存在特殊情形，如合同需双方签字盖章而甲方仅敲章，可能影响合同效力。以下为详细分析：

一、合同生效的一般要件

根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同生效一般需满足以下要件：

1. 行为人具有相应的民事行为能力：即签订合同的双方需具备签订合同的法律资格，如自然人需具备完全民事行为能力，法人需具备法人资格。
2. 意思表示真实：即合同双方签订合同的意思表示需真实、自愿，不存在欺诈、胁迫等情形。
3. 不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗：即合同内容需合法，不得违反国家法律法规的强制性规定，也不得违背社会公德和公共秩序。

在无固定期限合同的签订中，若甲方仅敲章而未签字，但合同内容符合上述要件，且甲方作为法人或具备相应民事行为能力的自然人，其敲章行为可视为对合同内容的认可，合同一般可认定为有效。

二、合同形式要件的特殊要求

虽然《民法典》未明确规定无固定期限合同必须采用书面形式并双方签字盖章，但在实际操作中，为了保障合同的严肃性和可证明性，许多合同（包括无固定期限合同）会约定采用书面形式，并要求双方签字盖章。若合同中有此类约定，则：

1. 若合同明确约定需双方签字盖章：则甲方仅敲章而未签字，可能不符合合同约定的形式要件，此时合同效力可能受到影响。但需注意的是，若甲方敲章行为能够充分证明其对合同内容的认可，且乙方未提出异议，法院或仲裁机构可能根据实际情况认定合同有效。
2. 若合同未明确约定需双方签字盖章：则甲方仅敲章行为，在符合合同生效一般要件的前提下，合同一般可认定为有效。

三、实践中的操作建议

1. 完善合同形式：为避免纠纷，建议在签订无固定期限合同时，明确约定合同形式（如书面形式）及双方签字盖章的要求。若甲方为法人，可要求其法定代表人或授权代表签字并加盖公章；若甲方为自然人，可要求其签字并捺手印。
2. 保留证据：在签订合同过程中，双方应妥善保留与合同签订相关的证据，如邮件、短信、聊天记录等，以证明合同签订的真实性和合法性。
3. 及时咨询：若对合同效力存在疑问或遇到纠纷，建议及时咨询专业律师，以便根据具体情况制定合适的解决方案。

举例说明：假设甲方为一家公司，与乙方签订了一份无固定期限劳动合同。合同中明确约定需双方签字盖章，但甲方仅加盖了公章而未签字。若乙方对此提出异议，认为合同未生效，此时法院或仲裁机构可能根据实际情况（如甲方敲章行为是否能够充分证明其对合同内容的认可、乙方是否已实际履行合同等）来认定合同效力。若认定合同有效，则双方需按照合同约定履行各自义务；若认定合同无效，则双方可能需重新协商签订合同或承担相应法律责任。

总结：甲方签无固定期限合同只敲章，合同是否有效需根据具体情况判断。在签订合同时，建议双方明确约定合同形式及签字盖章要求，并妥善保留相关证据。若遇到纠纷或疑问，可直接向我咨询。