基本农田上种植经济作物，一般由县级以上地方人民政府自然资源主管部门、农业农村主管部门依据各自职责进行处罚。以下是对此问题的详细分析：

一、基本农田的保护规定

基本农田是按照一定时期人口和社会经济发展对农产品的需求，依据土地利用总体规划确定的不得占用的耕地。为了保护基本农田，我国制定了严格的法律法规，如《基本农田保护条例》等，明确规定了基本农田的用途和保护措施。

二、种植经济作物的法律定性

在基本农田上种植经济作物，通常被视为改变了基本农田的用途，违反了基本农田的保护规定。经济作物虽然也是农业种植的一部分，但基本农田的主要用途是种植粮食作物，以确保国家的粮食安全。因此，在基本农田上种植经济作物，可能面临法律处罚。

三、处罚主体及依据

1. 处罚主体：

   • 县级以上地方人民政府自然资源主管部门：负责土地资源的管理和监督，对违反土地管理法规的行为进行处罚。
   • 县级以上地方人民政府农业农村主管部门：负责农业生产的指导和监督，对违反农业管理法规的行为进行处罚。

2. 处罚依据：

   • 主要依据《基本农田保护条例》等相关法律法规。这些法规明确规定了基本农田的保护措施和违法行为的处罚条款。

四、可能的处罚措施

具体的处罚措施可能因地区和具体违法情况而有所不同，但通常包括：

1. 责令改正：要求违法者立即停止在基本农田上种植经济作物的行为，并恢复基本农田的原状。
2. 罚款：根据违法情节的严重程度，对违法者处以一定数额的罚款。
3. 其他行政处罚：如没收违法所得、吊销相关许可证等。

五、特殊情况说明

如果种植的经济作物属于国家鼓励或支持的农业项目，且符合基本农田保护的相关规定，那么可能不会受到处罚。但这种情况需要具体分析，并符合相关法律法规的规定。

建议：如果你或他人计划在基本农田上种植经济作物，建议先咨询当地自然资源主管部门或农业农村主管部门，了解相关政策和法规，确保合法合规。如果已经面临处罚或存在法律纠纷，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。