结论：被判缓刑的职业医师三年后申请诊所能否当法人，需结合缓刑考验期表现、是否被剥夺政治权利、相关行业规定及地方政策综合判断。以下从不同角度详细分析：

一、缓刑考验期满后的法律地位

根据《中华人民共和国刑法》第七十六条，被宣告缓刑的犯罪分子，在缓刑考验期限内没有《刑法》第七十七条规定的情形，缓刑考验期满，原判的刑罚就不再执行，并公开予以宣告。这意味着，缓刑考验期满且无违规情形时，刑罚不再执行，但曾被判刑的记录仍然存在。这一记录本身并不直接剥夺其担任法人的资格，但可能成为相关行业主管部门或审批机构考量其资格的因素之一。

二、是否被剥夺政治权利

若职业医师在缓刑期间或之前被判处剥夺政治权利，那么在剥夺政治权利期间，其当然不能担任法人。因为担任法人通常需要具备一定的政治权利，如选举权和被选举权等（尽管直接关联性不强，但剥夺政治权利往往意味着个人社会信用和资格的受限）。若未被剥夺政治权利，则此方面不构成障碍。

三、医疗行业相关规定

根据《医疗机构管理条例》及其实施细则，设立医疗机构（包括诊所）的法人或主要负责人应当具备相应的医疗卫生专业知识和技能，并无不良执业行为记录。“不良执业行为记录”通常指的是在医疗卫生领域的违法违规行为，而非泛指所有犯罪记录。然而，具体到地方实施细则或部门规章，可能对法人的资格有更为严格的规定，如要求无犯罪记录等。因此，需查阅当地的具体规定以确定缓刑记录是否构成障碍。

四、地方政策与审批实践

不同地区对于医疗机构法人的资格审批可能存在差异。一些地区可能更加注重申请人的专业能力和过往执业记录，而对非医疗卫生领域的犯罪记录持较为宽容的态度；而另一些地区则可能采取更为严格的标准，要求申请人无任何犯罪记录。因此，了解并遵循当地的具体政策和审批实践至关重要。

五、建议与行动步骤

1. 查询当地规定：首先，应查询当地卫生健康行政部门或相关审批机构关于医疗机构法人资格的具体规定，了解缓刑记录是否构成障碍。
2. 准备相关材料：根据当地规定，准备必要的申请材料，包括个人身份证明、专业资格证书、无犯罪记录证明（如可能）等。
3. 咨询与沟通：在提交申请前，建议与当地审批机构进行沟通，了解其对缓刑记录的具体态度和处理方式，以便更好地准备申请材料。
4. 寻求专业帮助：如有需要，可寻求专业律师或医疗行业咨询机构的帮助，以确保申请过程的顺利进行。

最后，每个案件都有其独特性，上述分析仅为一般性指导。如有具体法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。