结论：单位无权因员工驾车违章未被交警扣分罚款而自行扣钱，此行为一般不合法，但存在特殊情形需具体分析。以下从不同角度为你详细分析：

从一般情况来看

• 法律依据：根据《工资支付暂行规定》第十六条规定，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
• 单位行为分析：员工驾车违章，若没有给单位造成实际的经济损失，单位仅仅以员工违章但未被交警扣分罚款为由扣钱，这种做法缺乏法律依据。因为单位不是交通执法部门，没有权力对员工的交通违章行为进行罚款性质的处罚。例如，员工在非工作时间、非因工作原因驾车违章，这种情况下与单位毫无关系，单位扣钱显然是不合法的。

从特殊情况来看

• 单位规章制度约定：如果单位的规章制度中明确规定，员工驾车违章（无论是否被交警扣分罚款），单位都有权扣除一定金额作为管理措施，并且该规章制度是经过民主程序制定（如经过职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定），已经向员工公示或者告知了员工，那么单位在一定程度上可能有权扣钱。但即便如此，扣除的金额也应当合理，不能超出必要的限度。比如，单位规定员工驾车违章一次扣除当月工资的5%，这种相对合理的规定可能在一定程度上会被认可；但如果扣除比例过高，如扣除当月工资的30%，就可能因不合理而不被支持。
• 因违章给单位造成损失：如果员工驾车违章的行为给单位造成了实际的经济损失，比如因为违章导致单位车辆被扣押，产生了拖车费、停车费等费用，或者因为违章导致单位承担了交通事故的赔偿责任等，那么单位可以根据实际情况，按照上述《工资支付暂行规定》第十六条的规定，从员工工资中扣除相应金额来赔偿损失，但同样要遵守每月扣除比例和最低工资标准的限制。

如果单位存在这种不合法扣钱的行为，你可以先与单位进行协商沟通，要求单位说明扣钱的理由和依据，并返还被不合理扣除的款项。如果协商无果，你可以向当地劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。要是你还有其他疑问，欢迎继续向我咨询。