合同签名后扫描件在一定条件下是有效的，但相较于原件，其证明力较弱且存在诸多风险。以下是对此问题的详细分析：
有效条件
双方认可：
- 如果合同双方均对扫描件所体现的合同内容表示认可，即承认该扫描件反映的是他们真实的意思表示，那么该扫描件在双方之间具有合同的拘束力。
符合民事法律行为有效要件：
- 根据《中华人民共和国民法典》第一百四十三条，一个有效的民事法律行为必须满足：行为人具有相应的民事行为能力；意思表示真实；不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。如果签字扫描件所代表的合同满足这些条件，即使它是扫描件形式，也可以认定为有效。
签字的真实性及签署人的民事行为能力：
- 扫描件中的签字必须是签署人的真实意思表示，且签署人在签署时必须具备完全民事行为能力。这是判断签字有效性的关键因素。
实际履行情况：
- 如果双方都对扫描签字的合同予以实际履行，且无异议，如一方依据扫描合同发货，另一方按约付款，这也从侧面证明了扫描件合同的有效性。
风险及特殊情形
证明力相对较弱：
- 合同签字扫描件的证明力相对于原件较弱。在民事诉讼中，根据相关规定，当事人应提供原件或原物作为证据。扫描件由于易于被技术手段篡改，因此在对方当事人对其真实性提出异议时，提供扫描件的一方可能需要承担更多的举证责任。
存在举证困难风险：
- 如果双方就合同发生纠纷，而仅有合同签字扫描件作为证据，且对方否认其真实性，又无法提供合同原件进行核对，同时缺乏其他佐证证据（如聊天记录、转账记录等），则法院可能不会采信该扫描件作为认定案件事实的依据。这可能导致主张合同权利的一方面临败诉的风险。
特殊领域或事项：
- 对于涉及人身权益、重大财产权益且有严格法定形式要求的合同（如土地转让、房产买卖等），一般需要当事人当面签字、按手印等，扫描签字可能不被认可。
- 对于需要经过特定审批、备案程序的合同（如外资企业设立合同、特许经营合同等），相关部门可能不接受扫描签字的合同，导致合同效力存在瑕疵。
建议与措施
优先使用原件：
- 在签订重要合同时，应尽量采用当面签订并留存合同原件的方式，以确保合同的合法有效性。
增强证明力：
- 如果无法取得原件，应特别注意收集其他相关证据来佐证合同关系的存在和内容，如聊天记录、转账记录、发货单等，以增强扫描件的证明力。
安全可靠的存储方式：
- 对于需要长期保存或具有重要法律意义的合同，建议采取更加安全可靠的存储方式，如电子签名、公证等，以确保合同的完整性和真实性。电子签名符合《中华人民共和国电子签名法》的规定，具有与手写签名同等的法律效力。
及时补签纸质合同：
- 如果因特殊情况只能先以扫描件形式签订，后续也应当及时补签纸质合同，并确保双方对扫描件的内容无异议。
综上所述，合同签字扫描件在一定条件下可以视为有效证据，但其法律效力和证明力可能受到多种因素的影响。为了确保合同的合法有效性并降低法律风险，建议在签订和保存合同时尽量使用原件，并采取必要的措施来增强其证明力。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。