单位食堂大肠杆菌超标属于食品安全问题，员工可依法主张赔偿，具体处理方式及赔付标准需结合实际情况分情况讨论：

一、责任主体与法律适用

1. 单位食堂的直接责任
   根据《食品安全法》第148条，食堂作为食品生产经营者，若提供不符合安全标准的食品（如大肠杆菌超标），需承担民事赔偿责任。员工可同时要求单位（食堂管理方）承担行政责任（如市场监管部门处罚）与民事责任（赔偿损失）。

2. 单位的管理责任
   若食堂由单位自营或委托第三方经营，单位作为管理者需对食堂的食品安全负责。若未尽到监督义务（如未定期检测、未留存进货凭证等），单位可能需与食堂共同承担连带责任。

二、赔付范围与标准

1. 基础赔偿项目

   • 医疗费用：因食用超标食物导致的诊疗费、药费、住院费等；
     
   • 误工费：因就医或康复产生的收入损失（需提供工资证明或纳税记录）；
     
   • 护理费：若需专人护理，按实际支出或当地护工标准计算；
     
   • 交通费：就医产生的合理交通费用（如打车费、公共交通票据）。

2. 惩罚性赔偿（需满足条件）
   若食堂明知食品不符合安全标准仍提供（如多次超标、未整改），员工可主张价款10倍或损失3倍的赔偿（以较高者为准）。例如：

   • 员工支付餐费20元，可主张200元赔偿；
     
   • 若因食物中毒住院花费5000元，可主张1.5万元赔偿。

三、处理流程与证据收集

1. 立即取证

   • 保存就餐凭证（如刷卡记录、收据）；
     
   • 留存食物样本（若可能）或拍摄食堂环境照片；
     
   • 及时就医并保存病历、检测报告（如粪便检测证明大肠杆菌感染）。

2. 协商与投诉

   • 内部协商：向单位后勤部门或工会反映，要求整改并赔偿；
     
   • 行政投诉：向当地市场监管部门举报（拨打12315），要求查处并出具检测报告；
     
   • 司法途径：若协商无果，可向法院起诉，主张民事赔偿（需提供证据证明因果关系）。

四、特殊情形提示

1. 集体性食物中毒
   若多人同时出现症状，可推定食堂责任，但需排除其他感染源（如员工自带食物）。建议集体委托律师处理，降低维权成本。

2. 单位拒不担责
   若单位以“员工自身体质问题”等理由拒绝赔偿，可申请司法鉴定（如检测食堂留样食物），或通过市场监管部门的处罚决定作为证据。

建议行动：

1. 优先与单位协商，明确赔偿金额及整改要求；
   
2. 若协商未果，尽快委托律师介入，通过法律程序固定证据并主张权益；
   
3. 关注食堂后续整改情况，避免再次发生类似问题。
   

如有进一步细节（如是否已就医、单位态度等），可随时补充说明，我会为您细化分析。