两个店共用一个烟草许可证，情节严重的可能构成非法经营罪。以下是对此问题的详细分析：
法律依据
根据《中华人民共和国刑法》第二百二十五条的规定，违反国家规定，有下列非法经营行为之一，扰乱市场秩序，情节严重的，构成非法经营罪：
- 未经许可经营法律、行政法规规定的专营、专卖物品或者其他限制买卖的物品的；
- 买卖进出口许可证、进出口原产地证明以及其他法律、行政法规规定的经营许可证或者批准文件的；
- 未经国家有关主管部门批准非法经营证券、期货、保险业务的，或者非法从事资金支付结算业务的；
- 其他严重扰乱市场秩序的非法经营行为。
烟草制品属于国家专营、专卖的物品，其经营必须获得烟草专卖行政主管部门的许可。如果两个店共用一个烟草许可证，实际上可能意味着其中一个或两个店铺在未经许可的情况下经营烟草制品，这违反了上述法律的第一项规定。
情节严重的认定
“情节严重”是构成非法经营罪的重要条件。在司法实践中，情节严重通常包括以下几种情况：
- 经营数额较大：如果两个店共用一个烟草许可证，且经营烟草制品的数额达到一定标准，可能被视为情节严重。
- 违法所得数额较大：如果通过共用一个烟草许可证经营烟草制品获得了较大的违法所得，也可能被视为情节严重。
- 造成严重后果：如果共用一个烟草许可证的行为导致了市场秩序严重混乱、消费者权益受损等严重后果，同样可能被视为情节严重。
法律后果
如果两个店共用一个烟草许可证，情节严重构成非法经营罪，将面临以下法律后果：
- 刑事处罚：根据《中华人民共和国刑法》第二百二十五条的规定，情节严重的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处违法所得一倍以上五倍以下罚金；情节特别严重的，处五年以上有期徒刑，并处违法所得一倍以上五倍以下罚金或者没收财产。
- 行政处罚：即使不构成犯罪，共用一个烟草许可证的行为也可能受到烟草专卖行政主管部门的行政处罚，如罚款、没收违法所得、吊销烟草专卖零售许可证等。
建议
- 合法经营：店铺应确保各自获得独立的烟草专卖零售许可证，合法经营烟草制品。
- 咨询专业律师：如果对烟草专卖法律法规有疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见。
综上所述，两个店共用一个烟草许可证，情节严重的可能构成非法经营罪，并面临刑事处罚和行政处罚。因此，店铺应严格遵守相关法律法规，合法经营烟草制品。