结论：设计院将企业标准设计进图纸的合法性需分情况讨论，关键在于企业标准是否符合国家强制性标准、是否履行告知义务以及是否损害第三方权益。以下从三个核心角度展开分析：
1. 企业标准与国家强制性标准的冲突性审查
根据《中华人民共和国标准化法》第二十一条，企业标准的技术要求不得低于强制性国家标准的相关技术要求。若设计院将企业标准（如内部设计规范、材料选用标准等）直接写入图纸，需确保：
- 不违反强制性标准：例如建筑结构的荷载计算、消防间距、抗震等级等必须符合《建筑设计防火规范》《建筑抗震设计规范》等国家强制性标准。若企业标准低于这些要求，即使写入图纸也属违法。
- 符合推荐性标准或行业惯例：对于非强制性的设计参数（如装饰材料的环保等级、设备选型等），企业标准可高于或等于推荐性国家标准，但需在图纸中明确标注依据（如“本设计采用XX企业标准，符合GB/T XXXX-202X推荐性标准”）。
2. 合同约定与告知义务的履行
设计院与建设单位（业主）的合同是判断合法性的关键依据：
- 合同明确授权：若合同中约定“设计院可采用企业标准完成设计，但需确保符合国家规范”，则设计院有权将企业标准融入图纸，但需保留书面证据（如会议纪要、邮件确认）。
- 未约定或约定模糊：根据《民法典》第五百一十条，若合同未明确标准适用，设计院应按“通常标准”或“符合合同目的的特定标准”履行义务。此时，若企业标准属于行业通用做法（如某类工业厂房的管线布局惯例），且未损害业主利益，通常合法；但若企业标准显著偏离行业惯例且未提前告知业主，可能构成违约。
3. 第三方权益保护与公开性要求
若设计图纸涉及第三方（如施工单位、监理单位）的使用，需注意：
- 不损害第三方权益：企业标准不得设置不合理的技术壁垒（如仅允许特定供应商的材料），否则可能违反《反不正当竞争法》第十二条的“技术限制”条款。
- 图纸公开性：根据《建设工程质量管理条例》第十八条，设计文件需经图审机构审查合格后方可使用。若企业标准未在图审中披露，即使符合国家规范，也可能因“未履行法定审查程序”被认定为违法。
实务建议
- 设计院：在图纸中标注企业标准时，应同步引用对应的国家标准或行业规范，并留存业主书面确认文件；对关键参数（如结构安全、消防性能）建议优先采用国家标准。
- 建设单位：若发现设计院使用企业标准，可要求其提供标准文本及与国家规范的对比说明，必要时委托第三方机构进行合规性审查。
- 争议解决：若因企业标准引发纠纷，可依据《标准化法》第三十二条向标准化行政主管部门投诉，或通过民事诉讼主张违约/侵权责任。
如有具体案例或合同条款需要分析，可直接向我提供细节，我会进一步结合法律条文与司法实践为您解读。