最后一手实际施工人是否需要缴纳工程税款，需分情况讨论，主要取决于其与上游转包方的合同约定以及税务登记情况。具体分析如下：

1. 若实际施工人以个人名义施工，且未进行税务登记
   根据《税收征收管理法》及增值税相关规定，工程款收入属于增值税应税范围。若实际施工人未办理税务登记（如个体工商户或公司注册），其收入仍需纳税，但通常由上游转包方作为扣缴义务人代扣代缴税款（如增值税、个人所得税等）。若转包方未履行代扣义务，实际施工人可能需自行补缴，并可能面临税务机关的追缴及罚款。

2. 若实际施工人以公司或个体工商户名义施工，且已进行税务登记
   此时实际施工人作为独立纳税主体，需自行申报并缴纳工程相关税款（如增值税、企业所得税或个人所得税、附加税等）。若上游转包方已支付工程款并代扣代缴部分税款，实际施工人需在申报时扣除已缴部分，避免重复纳税。

3. 合同约定对税款承担的影响
   即使合同中约定“税款由上游方承担”，实际施工人仍需关注税务合规性。根据《民法典》及税法原则，税务责任具有法定性，合同约定仅能转移经济负担（如由上游方补偿税款），但不能免除实际施工人的纳税义务。若税务机关追缴税款，实际施工人仍需先行缴纳，再依据合同向上游方追偿。

建议：

• 实际施工人应明确自身税务身份（个人/企业），并办理相应税务登记；
  
• 在合同中明确税款承担条款（如“税款由甲方承担，但乙方需提供合规发票”），并保留付款凭证、完税证明等证据；
  
• 若涉及多层转包，建议要求上游方提供代扣代缴证明，避免重复纳税或漏税风险；
  
• 发生纠纷时，可依据合同条款及税务机关的完税凭证，通过协商或诉讼解决税款分担问题。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询工程合同、税务合规等领域的法律问题。